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塩基配列決定による子宮頸癌、異形成、健常女性の網羅的HPV型データベースの構築

利用碱基测序构建宫颈癌、不典型增生和健康女性的综合 HPV 型数据库

基本信息

批准号：
14770861
负责人：
安里剛
金额：
$ 1.73万
依托单位：
University of the Ryukyus
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至 2003
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-14770861/
关键词：
HPV 子宮頸癌塩基配列塩基配列決定

项目摘要

本研究では、子宮頸部擦過細胞からヒトパピローマウイルス(HPV)DNAをL1コンセンサスプライマーを用いたPCRにて増幅、その塩基配列を決定し、感染HPV型を網羅的に決定した。この結果に基づき、頸部正常例および頸癌症例における各HPV型の型別感染頻度を解析するとともに発癌リスクの評価を行った(Asat et al. "A large case-control study on cervical cancer risk of HPV infection in Japan by nucieotide sequencing-based genotyping" J.Infect.Dis.印刷中)。異形成例についても同様の解析を行っている。頸部正常例および頸癌症例からは30種のHPV型を決定、そのうち18種のHPV型の発癌リスク評価を行った。正常例におけるHPV陽性率な約10%であり、型別感染頻度は、52、51、35、53、56、16、33、90、91型の順に高頻度であった。これは、海外における高い16、18型感染頻度とは対照的であった。一方、頸癌症例におけるHPV陽性率は約90%であり、16、33、58、18、52型の順に高頻度であった。これも、16、18聖で頸癌例数のほとんどを占めるとする従来の報告とは異なっていた。発癌リスクについては、71、90、91型がlow-risk型であることを世界で初めて確定した。本研究では、塩基配列決定により、従来の方法で検出されたHPV型よりもさらに多様なHPV型の感染実態が明らかになった。今後はバリアントも含めた塩基配列の情報と、病型、予後との関連も含めてこの研究をさらに発展させていきたい。

In this study, HPV DNA was amplified and sequenced by PCR to determine HPV infection. The results were analyzed for the frequency of HPV infection in primary, cervical normal and cervical cancer cases, and for the evaluation of cancer development (Asat et al. "A large case-control study on cervical cancer risk of HPV infection in Japan by nucleotide sequencing-based genotyping" J. Infect.Dis. in print). Different patterns are used to analyze the same pattern. Cervical normal cases and cervical cancer cases are divided into 30 HPV types and 18 HPV types. HPV positive rate in normal cases was about 10%, and infection frequency of HPV types was 52, 51, 35, 53, 56, 16, 33, 90 and 91. The frequency of infection of type 16 and type 18 is high. HPV positive rate of one side and neck cancer cases was about 90%, and HPV types 16, 33, 58, 18 and 52 were highly frequent. The number of cases of cervical cancer in the United States is 16 and 18, respectively. Type 71, Type 90, Type 91 are low-risk. This study was conducted to identify HPV types and to identify multiple HPV infection patterns. In the future, we will develop new research on the relationship between the disease type and gene structure.