ハイブリッド型第一原理分子動力学法による超臨界水中の反応に関する研究
ハイブリッド型第一原理分子動力学法による超臨界水中の反応に関する研究
批准号:
03J04075
负责人:
堀 拓実
金额:
$1.15万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004
中文摘要
点击翻译按钮获取中文摘要
英文摘要
本年度は、プログラムの汎用性を高め、超臨界水中の様々な反応系にQM/MM法を適用できるようにするための研究を行い、以下の成果を得た。一連の研究により、超臨界水中での量子化学をベースとした自由エネルギー計算の方法論、及びそれを様々な系に適用できる柔軟なプログラムの開発が完了した。1.分子内QM/MMプログラムの開発様々な系に柔軟に適応するために、分子内QM/MM法のプログラムを開発した。これまでに開発したQM/MM法のプログラムをベースに、分子力学計算の汎用パッケージであるTINKERを組み込み分子内QM/MM計算ができるように拡張した。これにより、溶質分子が大規模になっても計算が可能になった。2.QM/MMプログラムの並列化現実的な時間で計算を実行できるようにするために、QM/MMプログラムの並列化を行った。量子化学計算部分に採用した実空間グリッド法の利点が充分に発揮され、並列化したプログラムの効率は最大で90%に達した。これは既存のQM/MMプログラムと比べても明らかに優れた結果であると言える。3.エネルギー表示の理論による反応の自由エネルギー計算反応を評価する上で、最も重要な量である活性化エネルギーを高速かつ高精度に計算するためにエネルギー表示の理論を導入し、QM/MM法と融合させた。導入したプログラムを適用して、水の自己解離の自由エネルギー変化の計算を行い、超臨界水中でイオン種が溶媒の密度増加に伴って安定化される原因はエントロピーの増加にあることを明らかにした。エネルギー表示の理論の導入により、超臨界水中の反応の活性化自由エネルギーも現実的な時間で定量的に求めることが可能になった。
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Hideaki Takahashi: "A real-space-grid QM/MM study on the ionic/radical association reaction in aqueous phase : HCHO+OH→HCHO-OH"Journal of Molecular Structure(THEOCHEM). 632. 185-195 (2003)
Hideaki Takahashi:“水相中离子/自由基缔合反应的真实空间网格 QM/MM 研究:HCHO+OH→HCHO-OH”《分子结构杂志》(THEOCHEM) 632. 185-195 (2003)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Takumi HORI: "Hybrid quantum chemical studies for the methanol formation reaction assisted by the proton transfer mechanism in supercritical water : CH_3Cl+ nH_2O→CH_3OH+HCl+(n-1) H_20"The Journal of Chemical Physics. 119・16. 8492-8499 (2003)
Takumi HORI:“超临界水中质子转移机制辅助的甲醇形成反应的混合量子化学研究:CH_3Cl+ nH_2O→CH_3OH+HCl+(n-1) H_20”《化学物理杂志》119・16。 2003)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
An application of the novel quantum mechanical/molecular mechanical method combined with the theory of energy representation
新型量子力学/分子力学方法结合能量表示理论的应用
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Journal of Chemical Physics 119
影响因子:
--
作者:
[H.Takakashi]
通讯作者:
H.Takakashi