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膜タンパク構造形成原理の解明を目指したヘリックス間・ヘリックス-脂質間力の計測

螺旋间力和螺旋-脂质力的测量旨在阐明膜蛋白结构形成的原理

基本信息

批准号：
03J05377
负责人：
矢野義明
金额：
$ 1.22万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2004
项目状态：
已结题

项目摘要

膜タンパク質は、多種多様な脂質分子で構成される脂質二分子膜環境に存在しているため、その構造形成原理は水溶性タンパク質と大きく異なるが、その一般原理は殆どわかっていない。脂質二分子膜-タンパク質間相互作用を詳細に解明可能な方法論の発展が強く望まれている。研究代表者はこれまでに、多くの膜タンパク質の構成単位である膜貫通ヘリックスを形成する疎水性のモデルペプチドモデルペプチドX-(LALAAAA)_3-NH_2を用い、物理化学的手法によって、膜環境でのヘリックス-ヘリックスおよびヘリックス-脂質間相互作用の熱力学を詳細に計測可能な実験系を確立してきた。本年度は、膜貫通ヘリックスの疎水部の長さ膜疎水部の厚さのマッチングの熱力学に焦点をあて、ヘリックスの自己会合力および膜への分配が膜厚にどう影響を受けるかを調べた。ペプチドとして、上のものと組成は同じであるが対称な配列に変更したX-(AALALAA)_3-Y[X=NBD,Y=NH_2(III) or X=Ac,Y=DABMI(IV)]を用いた(長さ約30Åのヘリックスを形成)。膜疎水部の厚さは、不飽和結合を1つ持つアシル鎖を2本持つフォスファチジルコリンを用い、20Åから34Åまで変化させた。会合は薄い膜中では弱く(約-10kJ/mol)、膜が厚くなるほど強くなる(約-20kJ/mol)傾向にあった。また会合の温度依存性から、この会合がエンタルピー駆動であることがわかった。ヘリックス会合とは対照的に、膜厚がヘリックス長より薄すぎる、あるいは厚すぎる場合に、ヘリックスの膜への分配は減少した(薄い膜、厚い膜でそれぞれ約+2kJ/mol、約+8kJ/molの移行自由エネルギー)。薄い膜ではエントロピーの減少、厚い膜ではエンタルピーの増加により分配が妨げられていることが明らかになり、薄い膜と厚い膜での疎水部ミスマッチに対する応答は大きく異なることを示した。

The membrane is composed of a variety of lipid molecules. The structure of the lipid membrane exists in the environment of two molecules. The structure of the membrane is formed by the principle of water solubility. A detailed explanation of the interaction between lipid molecules and molecules is needed to develop a methodology for this study. The representative of the research team has studied the possible thermodynamic system of the membrane environment for the formation of the membrane penetration system X-(LALAAAA)_3-NH_2 using physico-chemical methods. This year, the film penetration, the film thickness, the film thickness, the thermodynamic focus, the film thickness, the film thickness distribution, the film thickness, the film thickness, the film X-(AALALAA)_3-Y[X=NBD,Y=NH_2(III) or X=Ac,Y=DABMI(IV)] is used in the middle (about 30 minutes long). The thickness of the membrane and the unsaturated combination are 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 1 The thin film tends to be weak (about-10kJ/mol) and the thick film tends to be strong (about-20kJ/mol). The temperature dependence of convergence is different. In the case of thin and thick films, the distribution of thin and thick films decreases (thin and thick films are about +2kJ/mol and about +8kJ/mol). The thin and thick films are divided into two parts: one part is thin and the other part is thick.