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両親媒性分子によって構成される機能膜に関する分子論的研究

两亲性分子组成的功能膜的分子研究

基本信息

批准号：
03J11651
负责人：
菊川豪太
金额：
$ 1.66万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2005
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では,生体膜を構成する両親媒性分子を対象に,ミクロスケールの動力学(例えば分子動力学法)からの情報を抽出し,よりマクロスケールでの動力学(ブラウン動力学,DPD法など),あるいは生体膜の連続体モデルに還元することによって,生体膜のマルチスケールモデル,シミュレーション手法を構築することを目指し,研究を行っている.最終年度となる今年度では,マルチスケールモデルの実証,方法論の構築に主眼を置いて研究を行った.昨年度までに,粒子描像でのマルチスケール手法(主にDPD法)の検証を行ってきたが,系の拡大による計算時間が依然として残り,また相互作用モデルのミクロスケールからの構築法に物理的意味づけが乏しいといった問題点があった.そこで,平均場近似を用いた場的な解析手法および限定的な範囲に粒子描像を用い,それ以外は連続体として扱うハイブリッド手法の可能性を検討した.その結果,平均場近似を用いる手法は,分子ポテンシャルのモデルをそのまま用いることができるというメリットがあるが,あくまで近似手法であるため,その部分でいかなる影響があるかを評価することが難しい.またダイナミクスの解析に用いるためには,未だいくらかの問題がある.これに対し,ハイブリッド手法を用いる方法論では,境界領域の取り扱いにいくらかの問題点を持っているが,溶媒の大部分を連続体として取り扱えるため,高速化という面でも非常に優位であることがわかった.また,MD法との比較を行った結果,非常によい一致を示していることが明らかになった.

In this study, the biofilm was used as a model of molecular dynamics (for example, molecular dynamics). In this study, the biofilm was used as a vector molecule. In this study, the biofilm was used in this study. In this study, the biofilm was used as an example of molecular dynamics (for example, molecular dynamics). I don't know what to do. I don't know what to do. The most recent year of the year, the most recent year, this year, this year. Last year, the particle image method (main DPD method) was used to calculate the residual energy in the calculation time, and the interaction method meant that there was no significant difference in physics. The average field is approximated by using the analytical technique of the field, the limited range of the particle image is used, and outside the field, the possibility of the technique is different. The results show that the average field is similar to that of the technique, and that of the molecule is similar to that of the control group, and the molecular method is similar to that of the control group. Please tell me that you are using this method, but you have not received any information about the problem. The method is to use the method to discuss the problem in the realm of realm. The problem is that most of the solvent is used in the field of solvent, and the high speed is very high. The MD method compares the results of the comparison results, and the results are very consistent.