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サツマイモ野生種の胞子体型自家不和合性における新規認識機構の分子的解明

野生甘薯孢子体自交不亲和性新识别机制的分子阐明

基本信息

批准号：
15780003
负责人：
土屋亨
金额：
$ 2.37万
依托单位：
Mie University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2004
项目状态：
已结题

项目摘要

本年度は、サツマイモ野生種の自家不和合牲遺伝子座(S遺伝子座)の単離ならびにS遺伝子座に座乗する各遺伝子の発現動態の解析を行った。サツマイモ野生種のS遺伝子座の単離はBACライブラリーのスクリーニングにより行われた。この領域の塩基配列の決定はショットガンシークエンスにより進められてきたが、当該遺伝子座が単純反復配刻(SSR)に富むことやGCクラスターに富むことなどにより、単一のコンティグを構築するには至らなかった。これらコンティグ間の7箇所のギャップ部分の塩基配列を決定するために、プライマーウォーク、ギャップ部分のPCR増幅、デリーションクローンの作製などを試みたが、前記の塩基配列の特徴が原因で現段階では全てのギャップ部分の塩基配列を決定するには至っていない。また、遺伝子推定プログラムにより、S遺伝子座上には43個のORFが存在していることが明らかになっている。ショットガンクローンをブロットしたメンブランに対し生殖器官のmRNAに由来するプローブをハイブリダイズして、各ORFに相当する領域の発現動態を調査するとともにノーザン分析で確認した。その結果、葯で特異的に発現すると思われる7遺伝子領域、柱頭で特異的に発現すると思われる5遺伝子領域が見いだされた。今後、S遺伝子座の完全長塩基配列を決定すると共に、見いだされた生殖器官特異的に発現する遺伝子領域の詳細な発現動態の解析をin situ分析、northern分析により行う予定である。

This year, the analysis of the occurrence dynamics of each gene in the wild species and its own disjunction gene (S gene) was carried out. The wild species of S. chinensis is isolated from the BAC. The determination of the base alignment of this domain is based on the following: 1. When the SSR is a pure repeat alignment (SSR), it is rich in GC base alignment, 2. When the SSR is constructed, it is rich in GC base alignment. The base arrangement of the 7 sites in the sequence is determined by PCR amplification, PCR amplification. There are 43 ORFs in the locus of the putative gene, and there are no ORFs in the locus of the putative gene. The development of the gene expression in the reproductive organs was investigated and confirmed. The results, drug-specific development, 7 genetic sub-domains, stigma-specific development, 5 genetic sub-domains, and 5 genetic sub-domains are described. In the future, the complete long base alignment of S gene loci will be determined in situ analysis and northern analysis.