雑種強勢のエピジェネティック分子機構

杂种活力的表观遗传分子机制

• 批准号: 04J10295
• 负责人: 小田 真由美
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-04J10295/
• 关键词: エピジェネティクス; DNAメチル化; 胎盤; 雑種第1代(F1)動物; HELP法; 栄養膜幹(TS)細胞; クローン動物; bioinformatics; RLGS法; 栄養膜幹細胞; 発生

平成17年度後半に引き続き、平成18年度前半は米国において、DNAマイクロアレイを用いたゲノムワイドDNAメチル化解析法であるHELP法の習得と改良を行った。哺乳類ゲノムにおけるDNAメチル化表的であるCpG2塩基配列の分布に着いてコンピューター解析を行い、HELP法で用いられているメチル化感受性酵素の認識配列によってDNAメチル化状態が解析可能なゲノム画分をより多くPCR増幅することで、特にDNAメチル標的の集中しているCpGアイランド領域の詳細な解析を可能にするためにHELP法に改良を加えた。さらに、解析結果を処理するためのコンピューター処理法についても習得・改良を行った。これまでに行ってきた雑種第1代特異的DNAメチル化可変領域(F1-DMR)の解析に加え、種間におけるDNAメチル化差異を比較した。比較においては種間のDNA配列差異(ジェネティック差異)とDNAメチル化差異(エピジェネティック差異)を区別するためのコンピューター解析方法についても検討した。こうして得られたDNAメチル化差異のある領域と、17年度までに行った、RLGS法と仮想RLGSイメージ(viRLGS法)を用いた胎盤、肝臓および腎臓におけるF1-DMR候補領域について、メチル化感受性酵素を用いたリアルタイムゲノムPCR法およびバイサルファイト処理ゲノムDNAを用いたpyrosequencing法によってDNAメチル化率を検討しF1-DMRの同定を進めた。

In the second half of Pingcheng 17, the United States was introduced in the second half of Pingcheng, and in the first half of Pingcheng 18, the United States and DNA were improved by using the analytical method, the HELP method, and the analytical method. In mammalian animals, the distribution of information on the basis of the DNA information table is based on the distribution of information. In this paper, we use the method of HELP to analyze the distribution of chemical receptive enzymes. In the analysis of the status of mammalian animals, we use the method of HELP to analyze the distribution of chemical receptive enzymes. In the analysis of the status, it is possible to analyze the pictures, images, pictures, images, and so on. It is possible to improve the HELP method by focusing on the field of CpG analysis. The results of the analysis and the results of the analysis show that the method has to be improved. The DNA of the first generation of Chinese and foreign products can be analyzed in the field of F1-DMR (F1-DMR). In addition, it can be used to compare the difference between the two systems. To compare the difference between the DNA configuration (the difference) and the DNA difference (the difference between the two groups), the difference between the two groups is different. The results show that there is a difference in the field of DNA, the year of 17, the method of RLGS, the method of RLGS, the method of viRLGS, the method of fetal pregnancy, the method of liver disease, and the field of F1-DMR. Chemosensory enzymes were used in this study. The PCR method was used to determine the sensitivity of the enzyme. The pyrosequencing method was used to determine the DNA susceptibility of the enzyme. The F1-DMR method was used to determine the sensitivity of the enzyme.