発光タンパク質イクオリンの構造変化とその発光機構の解明
発光タンパク質イクオリンの構造変化とその発光機構の解明
批准号:
15710170
负责人:
片山 由貴子
金额:
$2.11万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004
中文摘要
昨年度中に、Mg^<2+>を添加することによりMg^<2+>結合型イクオリンについて非会合状態で良質のNMRスペクトルが長時間測定可能な条件を見いだした。NMR解析のために、^<15>Nおよび^<13>C均一標識イクオリンを調製する条件(培地、プラスミド、培養条件等)を検討し、400mLの培地から数mgの標識イクオリンを得られるまでに最適化した。その後、発現・精製した^<15>N,^<13>C均一標識イクオリンについて各種多次元NMR (^<15>N HSQC, ^<13>CHSQC, HNCA, HNCOCA, CCONH, HNCACB, CBCACONH, HNCO, HNCACO,および^<15>N NOESY-HSQC)を測定し、主鎖の各プロトンの化学シフトを帰属した。しかし、ループ部分あるいはその付近と予想されるアミノ酸残基のいくつかの帰属等に不正確さが残った。そこで、アミノ酸選択的標識イクオリンを調製した。具体的には、^<15>N標識したメチオニンを培地に加え、培養条件を検討し、^<15>N-メチオニン標識イクオリンを調製した。(イクオリンには5個のメチオニンが存在する。)この標識体を用いてNMR測定することにより、Mg^<2+>結合型イクオリンの主鎖帰属をほぼ完全に行うことができた。また、Mg^<2+>イオンの濃度を変化させたNMR測定、いわゆるNMR滴定実験を行った。これらのNMR測定結果から、イクオリンに3箇所存在するEFハンドへのMg^<2+>の親和性の違いを定量的に見積もること等ができた。本研究から、Mg^<2+>によるイクオリン安定化の機構、Ca^<2+>添加によるイクオリンの構造変化過程についての予測が可能になり、発光機構解明への重要な基礎データを提供できた。
英文摘要
昨年度中に、Mg^<2+>を添加することによりMg^<2+>結合型イクオリンについて非会合状態で良質のNMRスペクトルが長時間測定可能な条件を見いだした。NMR解析のために、^<15>Nおよび^<13>C均一標識イクオリンを調製する条件(培地、プラスミド、培養条件等)を検討し、400mLの培地から数mgの標識イクオリンを得られるまでに最適化した。その後、発現・精製した^<15>N,^<13>C均一標識イクオリンについて各種多次元NMR (^<15>N HSQC, ^<13>CHSQC, HNCA, HNCOCA, CCONH, HNCACB, CBCACONH, HNCO, HNCACO,および^<15>N NOESY-HSQC)を測定し、主鎖の各プロトンの化学シフトを帰属した。しかし、ループ部分あるいはその付近と予想されるアミノ酸残基のいくつかの帰属等に不正確さが残った。そこで、アミノ酸選択的標識イクオリンを調製した。具体的には、^<15>N標識したメチオニンを培地に加え、培養条件を検討し、^<15>N-メチオニン標識イクオリンを調製した。(イクオリンには5個のメチオニンが存在する。)この標識体を用いてNMR測定することにより、Mg^<2+>結合型イクオリンの主鎖帰属をほぼ完全に行うことができた。また、Mg^<2+>イオンの濃度を変化させたNMR測定、いわゆるNMR滴定実験を行った。これらのNMR測定結果から、イクオリンに3箇所存在するEFハンドへのMg^<2+>の親和性の違いを定量的に見積もること等ができた。本研究から、Mg^<2+>によるイクオリン安定化の機構、Ca^<2+>添加によるイクオリンの構造変化過程についての予測が可能になり、発光機構解明への重要な基礎データを提供できた。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
国内基金
海外基金
登录
查看更多内容
分子筛催化甲醇转化中活性位动态变化机制的固体NMR研究
-
批准号:22502216
-
项目类别:青年科学基金项目(C类)
-
资助金额:30.00万元
-
批准年份:2025
-
负责人:胡敏
-
依托单位:
基于NMR研究磷脂酰肌醇磷酸酶SHIP2自抑制作用的分子机制
-
批准号:22504159
-
项目类别:青年科学基金项目(C类)
-
资助金额:30.00万元
-
批准年份:2025
-
负责人:王梓
-
依托单位:
NMR研究尤文肉瘤相关融合基因EWS-FLI1 RNA的可变剪接调控机制
-
批准号:22504158
-
项目类别:青年科学基金项目(C类)
-
资助金额:30.00万元
-
批准年份:2025
-
负责人:何小玲
-
依托单位:
基于细胞原位固体NMR的糖转运蛋白BjSemiSWEET动态转运机制研究
-
批准号:22577099
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:50.00万元
-
批准年份:2025
-
负责人:谢华勇
-
依托单位:
适用膜蛋白-配体复合物结构测定的1H和19F距离约束检测的固体NMR方法研究
-
批准号:JCZRYB202500181
-
项目类别:省市级项目
-
资助金额:--
-
批准年份:2025
-
负责人:
-
依托单位:
基于13C NMR的黄土高原半干旱区土壤有机碳稳定性对长期保护性耕作的响应机制
-
批准号:32572472
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:50.00万元
-
批准年份:2025
-
负责人:李玲玲
-
依托单位:
新颖高灵敏F-19 NMR光化学诱导动态核极化技术开发与活细胞应用探索
-
批准号:22574165
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:50.00万元
-
批准年份:2025
-
负责人:柴兆斐
-
依托单位:
新型Hoogsteen核酸链置换反应重启G四链体过氧化物酶活性的NMR研究
-
批准号:32571393
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:51.00万元
-
批准年份:2025
-
负责人:张钠
-
依托单位:
低旋磁比固体MAS NMR信号检测关键技术与方法的研究
-
批准号:22574167
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:50.00万元
-
批准年份:2025
-
负责人:张志
-
依托单位:
双金属改性分子筛催化甲烷选择性氧化反应的固体NMR研究
-
批准号:22572201
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:50.00万元
-
批准年份:2025
-
负责人:郝全果
-
依托单位: