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糸状性シアノバクテリアにおける新奇センサ-PASドメインの同定

丝状蓝细菌中新型传感器 PAS 结构域的鉴定

基本信息

批准号：
05J11585
负责人：
成川礼
金额：
$ 1.15万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2006
项目状态：
已结题

项目摘要

前年度までに、私は糸状性シアノバクテリアの比較ゲノム解析により、25個の推定センサーPASドメインを見出し、その機i能を探索した。特にヘム結合・フラビン結合PASドメインについてセンサーとしての機能を同定した。それ以外にも、分子内あるいは分子間ジスルフィド結合を形成するPASドメインも見出し、レドックスセンサーとしての機能が予測された。本年度においては、これら22個のPASドメインについてゲル濾過による分子量決定を行った。PASドメインの中には、二量化に機能するものも報告されており、今回の22個のPASドメインの中にも二量化に機能するものがあるかを探索した。その結果、6つのPASドメインは二量体として存在し、二量化ドメインとして機能している可能性が高い。続いて、本年度は新たにPASドメインと近縁なGAFドメインに着目した。GAFドメインもPASドメイン同様、配列の保存性は低いものの、立体構造は高度に保存されている。その立体構造はPASドメインとよく似ており、近年はPAS/GAFスーパーファミリーとして認識されている。GAFドメインの中でも、特に開環テトラピロールを結合する光受容体型GAFドメインに着目した。光受容体型GAFドメインは、そもそも高等植物における赤色光吸収型と遠赤色光吸収型の問を変換する光受容体、フィトクロムにおいて見出された。シアノバクテリアには、フィトクロムのGAFドメインと似て非なるGAFドメインが豊富に存在した。そこで、これらの多様なGAFドメインの網羅的なクラスター解析を行い、それぞれのサブクラスの代表的なGAFドメインについて網羅的に生化学解析を行った。その結果、フィトクロムのGAFドメインとは全く異なる新規の緑色一赤色光吸収型光受容体、紫色一緑色光吸収型光受容体などが多数検出された。これら以外にも多様な光受容体型GAFドメインがシアノバクテリアには存在するので、今後もさらなる新規光受容体の同定が期待できる。

In the previous year, the public information system and private information system were compared with each other, and 25 presumptive PAS certificates were found to be available, and the machine I could explore the information. The combination of the special equipment and the PAS system can be used to determine the same level of performance. The combination of extra-molecular and intramolecular-to-molecular interaction results in the formation of a PAS filter that can be seen, and the transmission mechanism can be transferred to each other. This year, the molecular weight of 22 PAS samples was determined by the molecular weight. In PAS, there are two kinds of information in the report, and in the 22 cases of PAS in this time, there are two kinds of equipment in the program. According to the results of the test, the probability of the existence of two-dimensional and two-dimensional PAS is high. This year, this year, the new PAS will pay close attention to the GAF. GAF has the same height as the PAS, arranges the "preservation", "low", "stereoscopic" height, "preservation". In the past few years, the PAS has become more and more popular. In recent years, there has been an increase in the number of people in the world. In recent years, there has been an increase in the number of people in the world. In the GAF system, special operation is performed in combination with the light-tolerant GAFT system to focus on the target. The photoreceptive type, the higher plant, the red light absorption type, the red light absorption type and the red light absorption type. Please tell me that there is something wrong with you, that is, if you are rich or rich, you may have GAF problems. The biochemical analysis line of the multi-user GAF network, the biochemical analysis line of the GAF network, and the biochemical analysis line of the network. The results showed that most of the new color-red light absorption photoreceptors and purple-color light absorption photoreceptors were found in the whole body of GAF photoreceptors. In addition, there are many kinds of light receptors. in the future, the new light capacitors will be the same as the expected ones.