原子レベルでの構造解析に基づくウィルスのDNAパッケージングモーターの動作基盤

基于原子水平结构分析的病毒DNA包装马达的运行基础

• 批准号: 17687014
• 负责人: 金丸 周司
• 金额: $ 12.4万
• 依托单位: Tokyo Institute of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17687014/
• 关键词: 蛋白質; ウイルス; 分子機械; 複合体; 分子モーター; 分子認識; ウィルス; バクテリオファージ; DNAパッケージング

本研究は、T4ファージを対象として、DNAがウィルス頭殻に詰め込まれる現象を原子レベルで明らかにしようとするものである。本年度の成果は下記の通りである:1.ネック蛋白質の発現・精製ネック蛋白質(gp13,gp14)について、発現・精製を行った。gp13,gp14はそれぞれ、単独で精製することに成功し、それぞれが単量体で存在することがわかった。また、0.4M以上濃度の硫酸アンモニウム存在下で二つの蛋白質を混合すると、(gp13)_<10>-(gp14)_5からなる複合体が形成することがわかった。2.ネック蛋白質の物理化学的解析上記(gp13)_<10>-(gp14)_5の電子顕微鏡観察、超遠心分析を行いこの複合体が溶液中で均一のリング状の構造を持ち、ファージ粒子中に存在する複合体であることを示した。3.結晶化、構造解析gp13,(gp13)_<10>-(gp14)_5について、結晶化に適した精製試料を用いて結晶化を試みている。具体的には、市販のグローバルな結晶化条件スクリーニングキットを用いて、蒸気拡散法により結晶化条件の初期検索を行っている。現在、構造解析に向けて充分な質と大きさを持った結晶を得るための条件を探索中である。

In this study, the T4 gene was detected by DNA sequencing. The achievements of this year are as follows:1. Development and purification of protein (gp13, gp14) gp13, gp14 are not available, they are not available, they are not available In the presence of sulfuric acid at concentrations above 0.4M, the two proteins were mixed, and (gp13)_<10>-(gp14)_5 complex was formed. 2. Physico-chemical analysis of protein: electron microscopic <10>observation and ultra-telecentric analysis of (gp13)_ -(gp14)_5. 3. Crystallization, structural analysis gp13,(gp13)_<10>-(gp14)_5 Crystallization, crystallization, refinement, sample preparation, crystallization, test Specific crystallization conditions, such as the initial crystallization conditions, are determined by evaporation method. Now, the structural analysis is in the process of exploring the conditions for obtaining crystallization.

项目成果

From structure of the complex to understanding of the biology.

从复杂的结构到对生物学的理解。

• 发表时间: 2007
• 期刊: Acta Cryst. D63
• 作者: Sugiyama;H.;K.Shimokata;N.Moriya;K.Imada;M.G.Rossmann
• 通讯作者: M.G.Rossmann

ウイルスに見られる新しいβ構造モチーフ

病毒中发现新的β结构基序

• 发表时间: 2007
• 期刊: 日本結晶学会誌 49
• 作者: 金丸周司;有坂文雄
• 通讯作者: 有坂文雄

バイオナノプロセスー溶液中でナノ構造を作るウェット・ナノテクノロジーの薦めー

Bionanoprocess - 推荐使用湿纳米技术在溶液中创建纳米结构 -

• 发表时间: 2008
• 作者: 山下一郎;芝 清隆;河村秀樹;三浦篤志;金丸周司;鈴木治和;臼井健悟;林崎良英;岩場健治;安部 聡;上野隆史;小林未明;塚本里加子;杉本健二;柏木健司;佐野健一;梅津光央;芹澤 武;松野寿生;松浦和則;高谷 光;磯崎勝弘;芳賀祐輔;上杉 隆;中谷昭彦;直田 健;村田 智;齊藤博英;井上 丹;佐々木善浩;田 文杰;菊池純一;浦岡行治;桐村浩哉;冬木 隆;熊谷慎也;吉井重雄;寒川誠二;鈴木直毅;安立京一;李 奉局;川合知二;一木隆範;マニッシュ・ビヤニ;根本直人;松尾保孝;居城邦治;田畑 仁;松井 宏;松村幸
• 通讯作者: 松村幸

バクテリオファージt4尾部の膜貫通機構

噬菌体T4尾部的跨膜机制

• 发表时间: 2007
• 作者: 二島渉;金丸周司;有坂文雄;北尾彰朗
• 通讯作者: 北尾彰朗

t4ファージ基盤構成蛋白質群のドメイン構造と相互作用部位の同定

t4噬菌体碱性蛋白组结构域结构和相互作用位点的鉴定

• 发表时间: 2007
• 作者: 中尾朋子;長尾達也;金丸周司;有坂文雄
• 通讯作者: 有坂文雄