物質循環計測を見据えた多次元NMRメタボノミクス法の開発
物質循環計測を見据えた多次元NMRメタボノミクス法の開発
批准号:
17710191
负责人:
菊地 淳
金额:
$2.3万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2006
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今年度は当該グループのオリジナル技術である高等植物の安定同位体標識技術を高度化し、特にモデル樹木・ポプラにも適用化した。茎からの寒天培地へのルーティングで、1ヶ月程度で葉から光合成由来の13CO2、あるいは根圏からの13C6-glucoseの取り込みがプラトーに達する事が分かった。この安定同位体標識技術を活かし、木質系バイオマスに必要とされる、固体状態での物性、構造解析を固体多次元NMR法を用いて展開する事が可能となった。一方で木質系バイオマス分解系として、シロアリ・腸内微生物分解系についても順調に代謝データが得られ始めてきた。特に、このような非モデル生物系ではゲノム情報から要素還元的にアプローチする事が難しいので、着目酵素の発現を抑えるRNAi技術と安定同位体標識技術を組み合わせる事により、微生物から宿主への複合生物間相互作用の観測を可能とした。他方で消費者の系としてマウスについても、新規の代謝データが得られている。例えば、動脈硬化に感受性の高い系統とそれ以外の系統を比較すると、腸内細菌の発酵産物である酢酸、乳酸、プロピオンが顕著に異なる事がわかった。これは腸内細菌との生物間相互作用が、動脈硬化との何らかの因果性をもっている可能性を示唆している。一方で、別の実験として、植物繊維の割合が高いコムギフスマを飼料中に混ぜたものと、コントロールとして通常通りの餌を摂食させたマウスの尿、糞の代謝産物を計測すると、尿でも摂食効果が顕著に現れる事がわかった。上述のように、生態系における生産者(植物)、消費者(動物)、分解者(微生物)の三者の相互作用を多次元NMRメタボノミクス法により計測する事で、生物間における物質循環を解析する目処が立った。これらの成果については、既にJ.Biol.Chem.誌、Phytochem..誌への受理が決まりつつある他、5報の論文を執筆中である。
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Structural and functional characterization of a mutant of Pseudocerastes persicus natriutic peptide
白拟角蠹钠肽突变体的结构和功能表征
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Prot. Pept. Lett. 13
影响因子:
--
作者:
[Elmi, M.M., Aminiasaab, M., Hondo, T., Kikuchi, J., Kuroda, Y., Naderi-Manesh, H., Sarbolouki, M.M.]
通讯作者:
M.M.
In vivo NMR
体内核磁共振
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
J. Spect. Soc. Jpn. 55
影响因子:
--
作者:
[Kikuchi, J., Akamine, K.]
通讯作者:
K.
Practical aspects of stable isotope labeling in higher plants for a hetero-nuclear NMR-based metabolomics
基于异核核磁共振的代谢组学在高等植物中稳定同位素标记的实际应用
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Method Mol. Biol. 358
影响因子:
--
作者:
[Kikuchi, J., Hirayama, T.]
通讯作者:
T.
Hetero-nuclear NMR-based metabolomics
基于异核核磁共振的代谢组学
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Biotech. Agri. Forest. 57
影响因子:
--
作者:
[Kikuchi, J., Hirayama, T.]
通讯作者:
T.
DOI:
10.1016/j.jmr.2005.01.004
发表时间:
2005-05-01
期刊:
JOURNAL OF MAGNETIC RESONANCE
影响因子:
2.2
作者:
[Horiuchi, T, Takahashi, M, Maeda, H]
通讯作者:
Maeda, H
共 6 条
Aquatic ecosystem improvement based on cyanobacterium bloom prediction
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批准号:22KF0406
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2023
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负责人:菊地 淳
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依托单位:
生体膜上で起こる相互作用解明のための脂質二重膜配向法の開発
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批准号:15710171
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.09万
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财政年份:2003
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负责人:菊地 淳
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依托单位:
膜貫通型タンパク質のNMR構造解析法の開発 -異方的構造情報の抽出-
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批准号:12780503
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.9万
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财政年份:2000
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负责人:菊地 淳
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依托单位:
金属相酸化バナジウムの量子臨界点近傍におけるスピン・軌道揺らぎのNMRによる研究
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批准号:12740218
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2000
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负责人:菊地 淳
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依托单位:
海外基金