細胞クローニング操作のデバイス化および遺伝子ライブラリーの網羅的機能評価

细胞克隆操作的设备化和基因库的综合功能评估

基本信息

  • 批准号:
    06J05162
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.64万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2006
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2006 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

種々生物の全遺伝子機能解明を目的とした遺伝子ライブラリー評価マイクロデバイスの開発を行った.単一微生物の分離・アレイ化システム,ライブラリー遺伝子導入システム,および電気化学的遺伝子機能評価システムを集積化した電気化学微小流路デバイスを構築した.流路チャネルは,細胞輸送用の直線状メインチャネル,およびその側面に作製した電気化学計測部位である微小チャンバーアレイから構成されている.チャネル内のマイクロ電極を用いた電気泳動により,単一微生物の各チャンバーへの分離,アレイ化を達成した.また,チャンバー内にあらかじめ固定化したプラスミドDNAを単一微生物へ導入し,遺伝子組換え微生物クローンアレイの構築を達成した.評価対象となるライブラリー遺伝子を個々のチャンバーに固定化することで,1チップ上でのライブラリー遺伝子導入細胞アレイを,一括操作で,簡便に構築可能である.チャンバー内のマイクロ電極を用い,数細胞の酵母のβ-galactosidase活性計測を実現した.β-galactosidaseは,細胞内での種々遺伝子機能評価におけるレポーターとして機能し,遺伝子の転写,翻訳レベルでの制御,翻訳後のタンパク質の折り畳み状態,タンパク質間相互作用などを評価可能とする.単一微生物の有するライブラリー遺伝子機能を高感度に計測することで,培養を必要としない迅速な機能評価が期待できる.また計測後において,電気泳動によるチャンバーからの目的微生物の回収を達成し,遺伝子配列決定や,遺伝子産物であるタンパク質の三次元構造評価など,本デバイスでは不可能な分子生物学的分析との併用を可能とした.つまり,本デバイスを用いた細胞レベルでの遺伝子機能評価,および分子生物学的手法による遺伝子,タンパク質レベルでの機能評価を行うことで,包括的なライブラリー遺伝子機能評価が達成される.
の 々 creatures all legacy 伝 sub function interpret を purpose と し た posthumous son 伝 ラ イ ブ ラ リ ー review 価 マ イ ク ロ デ バ イ ス の open 発 を line っ た. 単 a microbial の separation, ア レ イ change シ ス テ ム, ラ イ ブ ラ リ ー heritage 伝 son import シ ス テ ム, お よ び electric 気 chemical heritage 伝 sub function evaluation 価 シ ス テ ム を set product change し た electric 気 chemical tiny flow デ バ イ ス を build し た. Flow チ ャ ネ ル は, cells with の transmission line shape メ イ ン チ ャ ネ ル, お よ び そ の side に cropping し た electric 気 chemical measuring parts で あ る tiny チ ャ ン バ ー ア レ イ か ら constitute さ れ て い る. チ ャ ネ ル within の マ イ ク ロ を electrode with い た electric 気 swimming に よ り, a microbial の 単 each チ ャ ン バ ー へ の separation, ア レ イ change を reached し た. ま Within た, チ ャ ン バ ー に あ ら か じ め immobilized し た プ ラ ス ミ ド DNA を 単 a microbial へ import し, heritage 伝 subgroups in microbial ク え ロ ー ン ア レ イ の build を reached し た. Review 価 like と seaborne な る ラ イ ブ ラ リ ー heritage 伝 son を a 々 の チ ャ ン バ ー に immobilized す る こ と で, 1 チ ッ プ on で の ラ イ ブ ラ リ ー heritage 伝 import cells ア レ イ を, an enclosed で operation, simple に constructs may で あ る. チ ャ ン バ ー within の マ イ ク ロ electrode を い, number of yeast cells の の measuring beta - galactosidase activity を be presently し た. Beta - galactosidase は, intracellular で の kind 々 heritage 伝 sub function evaluation 価 に お け る レ ポ ー タ ー と し て function し, heritage 伝 son の planning to write, double 訳 レ ベ ル で の suppression, after turn 訳 の タ ン パ ク qualitative の fold り 畳 み state, タ ン パ ク qualitative interaction between な ど を may review 価 と す る. 単 a microbial の is す る ラ イ ブ ラ リ ー heritage 伝 sub function を Gao Gan degrees に measuring す る こ と で, cultivate を necessary と し な い な function quickly review 価 が expect で き る. ま た after measuring に お い て, electric 気 swimming に よ る チ ャ ン バ ー か ら の purpose microbial の back 収 を reach し, heritage 伝 with sequence decision や, heritage 伝 zi chan content で あ る タ ン パ ク qualitative の three yuan Construction review 価 な ど, this デ バ イ ス で は impossible な molecular biology analysis と の and を may と し た. つ ま り, this デ バ イ ス を with い た cells レ ベ ル で の heritage 伝 価 function evaluation, お よ び molecular biology technique に よ る heritage 伝, タ ン パ ク qualitative レ ベ ル で の function evaluation 価 を line う こ と で, including な ラ イ ブ ラ リ ー 伝 son function evaluation Youdaoplaceholder0 achieves される.

项目成果

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专利数量(0)
Electrochemical screening of recombinant protein solubility in Escherichia coli using scanning electrochemical microscopy (SECM)
使用扫描电化学显微镜 (SECM) 电化学筛选重组蛋白在大肠杆菌中的溶解度
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    F.Okahara;K.Itoh;M.Ebihara;M.Kobayashi;H.Maruyama;Y.Kanaho;T.Maehama;Masaya Mitsuishi;Hiroshi Endo;Masaya Mitsuishi;M.Mitsuishi;K.Nagamine et al.
  • 通讯作者:
    K.Nagamine et al.
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  • 作者:
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
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  • 影响因子:
    0
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    小山大介
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    土屋直柔、外山健、畠山賢彦、永井康介、長谷川雅幸、A. Almazouzi;E. van Walle;R. Gerard;長峯 邦明;D. Oyama;Oyama D;小山大介;D.Oyama;小山大介;小山大介;小山大介
  • 通讯作者:
    小山大介
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    土屋直柔、外山健、畠山賢彦、永井康介、長谷川雅幸、A. Almazouzi;E. van Walle;R. Gerard;長峯 邦明;D. Oyama;Oyama D;小山大介;D.Oyama;小山大介;小山大介;小山大介;D. Oyama;D. Oyama;小山大介;小山大介;D. Oyama;D. Oyama;小山大介;小林宏一郎;小山大介;佐藤可織;佐藤可織;岡本創;岡本創;岡本創;山本真之;Andrew J. Heymsfield;山本真之;佐藤可織;佐藤可織;佐藤可織;佐藤可織;岡本創;佐藤可織;佐藤可織;佐藤可織;佐藤可織;佐藤可織
  • 通讯作者:
    佐藤可織
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    土屋直柔、外山健、畠山賢彦、永井康介、長谷川雅幸、A. Almazouzi;E. van Walle;R. Gerard;長峯 邦明;D. Oyama;Oyama D;小山大介;D.Oyama;小山大介;小山大介;小山大介;D. Oyama;D. Oyama;小山大介;小山大介
  • 通讯作者:
    小山大介

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  • 财政年份:
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