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DNAチップデータを用いたテーラーメイド医療実用化のための患者分類新手法の確立

利用DNA芯片数据建立新的患者分类方法以实现个性化医疗的实际应用

基本信息

批准号：
06J06550
负责人：
高橋広夫
金额：
$ 0.77万
依托单位：
National Cancer Center Research Institute and Research Center for Innovative Oncology, National Cancer Center Hospital East
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-06J06550/
关键词：
がん診断遺伝子発現解析診断マーカー

项目摘要

国立がんセンターでは、ミレニアム・ゲノム・プロジェクトで得られたがん患者に関する遺伝子発現情報や一塩基多型(SNP)のデータベースを構築しており、私は、この情報を用いて、がんの治療標的や診断マーカーの同定及び、同定するための手法の開発を目指した。まず、食道がんの遺伝子発現情報を用いて、食道がんの中でも、特に予後の悪い壁内転移症例(IM)と、その他の症例(non-IM)に関して、遺伝子発現に違いがあるという仮説を立て、新解析手法であるPART-BFCS法で解析を試みたところ、CDK6を含む遺伝子セットを用いることで、適切にIMとnon-IMを診断できることが分かった。遺伝子CDK6は、細胞周期に関連する遺伝子であることから、IMとnon-IMでCDK6の発現に差があるとすれば、予後の違いとして現れるのは、妥当である。このようにPART-BFCS法により、有望なマーカー遺伝子の候補として、遺伝子CDK6を含む遺伝子セットを抽出することが出来た。また、同様に、軟部腫瘍の解析においてPART-BFCS法で解析を行い、診断や治療標的として有用な遺伝子MIFを抽出することが出来た。MIFは、大腸がんでは、治療標的として報告があったが、軟部腫瘍でも、診断マーカーや治療標的になり得ることが、このPART-BFCS法による解析から初めて明らかになった。次に、抗がん剤に対する患者の薬物応答性(薬剤の効果や副作用)の程度を予測するために、一塩基多型(SNP)情報解析を行った。抗がん剤イリノテカン・5FUを投与した症例のSNP情報に対し、統計的な手法を探索的に用いて、有望な候補SNPを絞り込むことが出来た。これらのマーカーは、今後、症例数追加によるバリデーションを行うことで、臨床的に有用なマーカーとなるだろう。

The National Institute of Health and Wellness provides guidance on the development of methods for identifying and identifying patients with genetic information and SNP information. In addition, the new analysis method of PART-BFCS method is used to analyze the information of gene expression in esophagus, esophagus, especially in the middle of the esophagus, especially in the later intramural migration (IM) and other cases (non-IM), and to diagnose IM non-IM. CDK6 gene expression, cell cycle correlation, gene expression, IM, non-IM, CDK6 gene expression, gene expression, The PART-BFCS method is used to extract the candidate information from the CDK6. PART-BFCS method for analysis of soft tissue tumors, diagnosis and treatment targets, and extraction of useful MIF MIF, large intestine, treatment target report, soft part swelling, diagnosis, treatment target, analysis Second, to predict the degree of patient's biological response (drug and side effects), and to analyze multi-type (SNP) information 5FU is used to detect SNP information and statistical methods. It is expected that SNP candidates will be identified. In the future, the number of cases will be increased.