動物細胞のゲノム複製タイミングに関わる機能領域の同定とその分子制御機構の解明

动物细胞基因组复制计时相关功能区的鉴定及其分子控制机制的阐明

基本信息

项目摘要

真核細胞のゲノム複製タイミングは、複製起点活性や複製フォーク進行に依存し、クロマチンの活性化状態と関連する。しかし、複製タイミング制御の分子機構はよくわかっていない。本研究では、複製タイミング制御の分子機構を解明するため、サイトカイン遺伝子群を含むヒト5q23/31(約3.5Mb)の複製タイミングを解析した。まず、サイトカイン遺伝子を発現するヒトT細胞株(Jurkat)および発現しない非T細胞株(HL-60)を用いて複製タイミングの比較解析したところ、サイトカイン遺伝子群領域から約1Mb上流において両細胞型で異なる複製タイミングの転換領域を見出した。また、より広範囲な領域を対象としたゲノム解析から、AT richな非コード領域が複製タイミングの転換に関与することが予想された。そこで、T細胞特異的核マトリックス結合タンパク質として知られるspecial AT-rich sequence binding protein 1(SATB1)に着目した。相同性検索から、異なる3種のSATB1結合類似配列がクラスターし、複製タイミングの境界領域内及びその近傍に存在することが判明した。さらに複製タイミングとSATB1タンパクの発現の関連を調べたところ、細胞特異的転換領域内において、SATB1高発現細胞は複製後期、低発現および発現していない細胞では複製中期-初期であった。以上の結果から、細胞特異的複製タイミングの転換とSATB1によるクロマチンの高次構造変化との関連が示唆された。
Eukaryotic organisms are dependent on replication initiation, replication initiation activity, and replication activation status. The molecular mechanism of the control system is to copy and copy the information. In this study, the molecular mechanism of replication control was analyzed, including the molecular mechanism of replication control in 5q23/31(about 3.5Mb). A comparative analysis of the replication pattern of T cell lines (Jurkat) and non-T cell lines (HL-60) using the Jurkat and non-T cell lines was performed. The domain of Jurkat and non-T cell lines was found to be about 1Mb upstream. For example, if you want to change the domain name, you can change the domain name. T-cell specific nuclear binding protein 1(SATB1) is targeted. The three kinds of SATB1 with the similarity index and the difference index can be identified by combining the similarity index with the similarity index and the difference index. SATB1 is highly active in late replication and low in late replication and early replication in cell-specific transition domains. The results above indicate that the cell-specific replication patterns are related to the higher-order structural changes of SATB1.

项目成果

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サイトカイン遺伝子領域における複製開始点および複製タイミングの解析
细胞因子基因区域复制起点和复制时间分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    宮武昌一郎;尾田真子;佐藤憲子;青木和久;正井久雄
  • 通讯作者:
    正井久雄
DNA replication timing of human chromosome 5q23/31 region
人类染色体5q23/31区域的DNA复制时间
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    I. Rzeznicka;G. W. Wurpel;M. Bonn;M. A. van der Horst;K. Hellingwerf;S. Matsunaga;T. Yamada;M. Kawai;Daiju Tsuchiya et al.;Daiju Tsuchiya et al.;尾田真子
  • 通讯作者:
    尾田真子
ヒト第5染色体5q23/31領域のゲノム複製タイミングの解析
人类5号染色体5q23/31区域基因组复制时序分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    尾田真子;加納 豊;正井久雄
  • 通讯作者:
    正井久雄
サイトカイン遺伝子領域の複製開始点orilL-13におけるpreRCの解析
细胞因子基因区复制起点orilL-13的preRC分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    宮武昌一郎;尾田真子;青木和久;正井久雄
  • 通讯作者:
    正井久雄
日本学術振興会特別研究員RPDの取り組み -RPD採用者の報告-
日本学术振兴会特别研究员 RPD 倡议 -来自 RPD 采用者的报告 -
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    I. Rzeznicka;G. W. Wurpel;M. Bonn;M. A. van der Horst;K. Hellingwerf;S. Matsunaga;T. Yamada;M. Kawai;Daiju Tsuchiya et al.;Daiju Tsuchiya et al.;尾田真子;尾田真子
  • 通讯作者:
    尾田真子
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