放射光低エネルギーX線を用いた蛋白質結晶構造解析手法の開発

同步加速器低能X射线蛋白质晶体结构分析方法的开发

基本信息

  • 批准号:
    18770098
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.18万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 财政年份:
    2006
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2006 至 2007
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

低エネルギー領域のX線を利用した蛋白質結晶の解析手法(低エネルギーSAD法)は、解析の困難な膜蛋白質や高等生物由来の蛋白質にも適用が可能な手法として期待されている。しかしながら、解析に用いる軽原子からの異常散乱シグナルが非常に微弱であることや、低エネルギー領域ではX線の吸収効果が増大しデータ精度を悪化させる要因となることから、回折実験ではシグナルの向上させとノイズを極力減らすよう格段の配慮が必要となる。本研究では、低エネルギーSAD法をより高度化、汎用化させることを目的として、放射光ビームラインを用いて精度の高いデータ収集を行うための実験手法の開発を行ってきた。平成19年度は、複数の結晶からの回折データの足し合わせ、及び平均化を行うことで、データ精度を向上させ、正確な異常散乱シグナルを測定して解析の成功率を向上させることが出来ないかどうかについて検討を行った。その結果、2〜3個の結晶を平均化するとデータの質は悪化し、解析の成功率が下がるが、ある程度以上の数の結晶を用いることで、データの質が改善し、解析の成功率が上がることが分かった。この結果は回折データの足し合わせの有効性を示すだけでなく、微小な結晶のように放射線損傷の影響で単一の結晶から回折データセットを取得できないような試料に対しても、複数の結晶で精度の高い完全データセットを得ることが可能であることを示唆しており、大変有意義なものである。
In the field of low molecular weight, we used the method of protein crystal analysis (SAD method), the analysis of membrane protein, the origin of advanced biology, the possibility of protein analysis, the possibility of protein analysis, the analysis of membrane protein, the origin of advanced biology, the possibility of protein analysis, the use of possible methods, and the use of possible techniques. In this paper, we use the method of analysis, which is very weak, the field is low, the precision is high, and the precision is high. It is necessary to improve the accuracy of the system. In this study, the high-level, low-level and low-level SAD methods are used in this study. in this study, the high-level, low-precision, high-precision and high-precision methods are used in this study. In the year of Pingcheng, in the year 19, the results of the complex data analysis showed that the data were fully integrated and averaged, and the accuracy was improved, and the accuracy was correctly determined. The success rate of the analysis method was higher than that of the previous year. The results of the test, the average of the results of the two and three results, the analysis of the success rate, the lower and the higher levels of the results, the results of the results, the average results of the results, the average results of the results, the results of the results, the average results of the results, the results of the results, the average of the results, the average of the results, the results of the results, the average of the results, the results of the results, the average of the results, the results of the results, the average of the results, the results of the results, the results of the results, the average of the results, the results of the results, the average of the results, the results of the results, the average of the results, the results of the results, the average of the results, the results of the results, the results of the results, the average of the results, the results of the results, the results of the The results show that the results show that the data is accurate and the accuracy is high. The results show that the accuracy of the data is very high, and the accuracy of the data is very high. The results show that the results show that the accuracy of the data is very high, and the accuracy of the data is high.

项目成果

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专著数量(0)
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会议论文数量(0)
专利数量(0)
Recent developments for lower energy SAD phasing in the Photon Factory macromolecular crystallography beamline
Photon Factory 高分子晶体学光束线中低能 SAD 定相的最新进展
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Y. Yamada;N. Igarashi;N. Matsugaki;M. Hiraki;M. Kawasaki;R. Kato and S. Wakatsuki
  • 通讯作者:
    R. Kato and S. Wakatsuki
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  • 通讯作者:
    陣内浩司
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    小祝 孝太郎;月本 準;東 哲也;真板 宣夫;山田 悠介;平木 雅彦;加藤 龍一;千田 俊哉;Chavas Leonard;伊藤 孝司;湯本 史明
  • 通讯作者:
    湯本 史明
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  • 通讯作者:
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