超好熱菌由来モデルタンパク質の熱力学的安定性解析
超嗜热菌模型蛋白的热力学稳定性分析
基本信息
- 批准号:18770133
- 负责人:
- 金额:$ 2.37万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份:2006
- 资助国家:日本
- 起止时间:2006 至 2007
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本研究では、タンパク質立体構造の安定化機構について、これまで常温生物由来のモデルタンパク質を用いた系統的解析より得られた知見の普遍性検証と、これまで抽出されず見落とされてきた新たな知見の発掘を目的として、超好熱菌由来モデルタンパク質の熱力学的安定性解析を行った。具体的には、超好熱菌由来モデルタンパク質RNaseHおよびその変異体の平衡論的・速度論的安定性の物理化学的解析に取り組んだ。これまで常温生物由来のモデルタンパク質の系統的変異タンパク質を用いた安定性研究から得られている安定化因子とその寄与の大きさについて、Tk-RNaseHを用いてその普遍性を検証した。Tk-RNaseHは平衡論的および速度論的にも安定化されているタンパク質であり、これまで研究されてきたタンパク質と異なる性質を持つ。平衡論的および速度論的にも安定化されているTk-RNaseHについて、どの様な残基や因子が平衡論的または速度論的安定性に寄与しているのかを明らかにするために、幾つかのタイプの変異体(疎水性型、Pro型)を作製し、その平衡論的および速度論的安定性を測定し、野生型と比較した。その結果、Tk-RNaseHに多く含まれるPro残基が速度論的安定化に寄与していること、分子内疎水性残基が速度論的安定化に寄与していることが明らかになった。これまで安定化因子であると考えられている疎水性相互作用に関して、安定性変化を調べた結果、特に顕著な違いは見られなかった。このことは、超好熱菌タンパク質も通常のタンパク質と同様の機構で安定化されていることを示唆している。
This study で は, タ ン パ ク mass three-dimensional structure の stabilization institutions に つ い て, こ れ ま で room temperature biological origin の モ デ ル タ ン パ ク qualitative を with い た system analytical よ り have ら れ た knowledge universality の 検 と, こ れ ま で spare さ れ ず see fall と さ れ て き た new た な knowledge の 発 dug を purpose と し て, super hot bacteria origin モ デ ル タ ン パ ク の thermodynamics The stability analysis of を line った. Specific に は, super hot bacteria origin モ デ ル タ ン パ ク qualitative RNaseH お よ び そ の - variant の theory of equilibrium theory, speed stability の physical and chemical analytical に take り group ん だ. こ れ ま で room temperature biological origin の モ デ ル タ ン パ ク qualitative の system - different タ ン パ ク qualitative を with い た stability study か ら have ら れ て い る stabilization factor と そ の send with の き さ に つ い て, Tk - RNaseH を with い て そ の universality を 検 card し た. Tk - RNaseH は equilibrium theory of お よ び speed theory に も stabilization さ れ て い る タ ン パ ク qualitative で あ り, こ れ ま で research さ れ て き た タ ン パ ク qualitative と different な を hold つ る properties. Theory of equilibrium theory of お よ び speed に も stabilization さ れ て い る Tk - RNaseH に つ い て, ど の others な residues や factor が equilibrium theory of ま た は speed theory of stability に send し て い る の か を Ming ら か に す る た め に, several つ か の タ イ プ の - variants (疎 water-based, Pro) を as し, そ の equilibrium theory of お よ び speed theory Qualitative を determination of と and wild-type と comparison of た. そ の results, Tk - RNaseH に く more contain ま れ る Pro residues が speed theory of stabilization に send し て い る こ と, intramolecular 疎 waterborne residues が speed theory of stabilization に send し て い る こ と が Ming ら か に な っ た. こ れ ま で stabilization factor で あ る と exam え ら れ て い る 疎 water-based interaction に masato し て, stability - を adjustable べ た results, に 顕 the な violations い は see ら れ な か っ た. こ の こ と は, super hot bacteria タ ン パ ク qualitative も usually の タ ン パ ク qualitative と with others の institutions で stabilization さ れ て い る こ と を in stopping し て い る.
项目成果
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专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Osmolyte effect on the stability and folding of a hyperthermophilic protein
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- 发表时间:2008-04-01
- 期刊:
- 影响因子:2.9
- 作者:Mukaiyama, Atsushi;Koga, Yuichi;Kanaya, Shigenori
- 通讯作者:Kanaya, Shigenori
The role of proline residues in the stability of Tk-RNase HII
脯氨酸残基在 Tk-RNase HII 稳定性中的作用
- DOI:
- 发表时间:2007
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Higashi;et. al.
- 通讯作者:et. al.
A hyperthermophilic protein acquires function at the cost of stability
- DOI:10.1021/bi060907v
- 发表时间:2006-10-24
- 期刊:
- 影响因子:2.9
- 作者:Mukaiyama, Atsushi;Haruki, Mitsuru;Kanaya, Shigenori
- 通讯作者:Kanaya, Shigenori
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