超好熱菌由来モデルタンパク質の熱力学的安定性解析
超好熱菌由来モデルタンパク質の熱力学的安定性解析
批准号:
18770133
负责人:
高野 和文
金额:
$2.37万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007
中文摘要
本研究では、タンパク質立体構造の安定化機構について、これまで常温生物由来のモデルタンパク質を用いた系統的解析より得られた知見の普遍性検証と、これまで抽出されず見落とされてきた新たな知見の発掘を目的として、超好熱菌由来モデルタンパク質の熱力学的安定性解析を行った。具体的には、超好熱菌由来モデルタンパク質RNaseHおよびその変異体の平衡論的・速度論的安定性の物理化学的解析に取り組んだ。これまで常温生物由来のモデルタンパク質の系統的変異タンパク質を用いた安定性研究から得られている安定化因子とその寄与の大きさについて、Tk-RNaseHを用いてその普遍性を検証した。Tk-RNaseHは平衡論的および速度論的にも安定化されているタンパク質であり、これまで研究されてきたタンパク質と異なる性質を持つ。平衡論的および速度論的にも安定化されているTk-RNaseHについて、どの様な残基や因子が平衡論的または速度論的安定性に寄与しているのかを明らかにするために、幾つかのタイプの変異体(疎水性型、Pro型)を作製し、その平衡論的および速度論的安定性を測定し、野生型と比較した。その結果、Tk-RNaseHに多く含まれるPro残基が速度論的安定化に寄与していること、分子内疎水性残基が速度論的安定化に寄与していることが明らかになった。これまで安定化因子であると考えられている疎水性相互作用に関して、安定性変化を調べた結果、特に顕著な違いは見られなかった。このことは、超好熱菌タンパク質も通常のタンパク質と同様の機構で安定化されていることを示唆している。
英文摘要
本研究では、タンパク質立体構造の安定化機構について、これまで常温生物由来のモデルタンパク質を用いた系統的解析より得られた知見の普遍性検証と、これまで抽出されず見落とされてきた新たな知見の発掘を目的として、超好熱菌由来モデルタンパク質の熱力学的安定性解析を行った。具体的には、超好熱菌由来モデルタンパク質RNaseHおよびその変異体の平衡論的・速度論的安定性の物理化学的解析に取り組んだ。これまで常温生物由来のモデルタンパク質の系統的変異タンパク質を用いた安定性研究から得られている安定化因子とその寄与の大きさについて、Tk-RNaseHを用いてその普遍性を検証した。Tk-RNaseHは平衡論的および速度論的にも安定化されているタンパク質であり、これまで研究されてきたタンパク質と異なる性質を持つ。平衡論的および速度論的にも安定化されているTk-RNaseHについて、どの様な残基や因子が平衡論的または速度論的安定性に寄与しているのかを明らかにするために、幾つかのタイプの変異体(疎水性型、Pro型)を作製し、その平衡論的および速度論的安定性を測定し、野生型と比較した。その結果、Tk-RNaseHに多く含まれるPro残基が速度論的安定化に寄与していること、分子内疎水性残基が速度論的安定化に寄与していることが明らかになった。これまで安定化因子であると考えられている疎水性相互作用に関して、安定性変化を調べた結果、特に顕著な違いは見られなかった。このことは、超好熱菌タンパク質も通常のタンパク質と同様の機構で安定化されていることを示唆している。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI:
10.1002/prot.21660
发表时间:
2008-04-01
期刊:
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS
影响因子:
2.9
作者:
[Mukaiyama, Atsushi, Koga, Yuichi, Kanaya, Shigenori]
通讯作者:
Kanaya, Shigenori
The role of proline residues in the stability of Tk-RNase HII
脯氨酸残基在 Tk-RNase HII 稳定性中的作用
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Higashi, et. al.]
通讯作者:
et. al.
DOI:
10.1021/bi060907v
发表时间:
2006-10-24
期刊:
BIOCHEMISTRY
影响因子:
2.9
作者:
[Mukaiyama, Atsushi, Haruki, Mitsuru, Kanaya, Shigenori]
通讯作者:
Kanaya, Shigenori
実験データに基づく蛋白質立体構造評価システム
-
批准号:18016017
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
-
资助金额:$3.52万
-
财政年份:2006
-
负责人:高野 和文
-
依托单位:
蛋白質モデリング・デザイニング評価システムの開発と応用
-
批准号:15014220
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
-
资助金额:$2.18万
-
财政年份:2003
-
负责人:高野 和文
-
依托单位:
蛋白質立体構造中の二次構造を規定する因子の解明
-
批准号:98J00788
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$2.3万
-
财政年份:1998
-
负责人:高野 和文
-
依托单位:
国内基金
海外基金
登录
查看更多内容
基于物理信息神经网络的拓扑优化与结构安定性评估
-
批准号:
-
项目类别:省市级项目
-
资助金额:--
-
批准年份:2025
-
负责人:
-
依托单位:
HMX晶体炸药超精密切削界面摩擦热安定性的理论研究
-
批准号:52305517
-
项目类别:青年科学基金项目
-
资助金额:30.00万元
-
批准年份:2023
-
负责人:曹志民
-
依托单位:
微生物矿化提升钢渣细集料安定性的生物化学机理和技术基础
-
批准号:--
-
项目类别:青年科学基金项目
-
资助金额:30万元
-
批准年份:2022
-
负责人:伊海赫
-
依托单位:
交通荷载下加筋土结构的安定性评价方法及其应用研究
-
批准号:2022JJ30257
-
项目类别:省市级项目
-
资助金额:--
-
批准年份:2022
-
负责人:刘泽
-
依托单位:
常温常压下微生物促成利用烟气CO2提升钢渣掺合料安定性和活性的生物化学机理与动力学规律
-
批准号:--
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:59万元
-
批准年份:2021
-
负责人:钱春香
-
依托单位:
高温条件下细观层面沥青混合料抗剪强度研究及沥青道路的安定分析
-
批准号:LQ21E080024
-
项目类别:省市级项目
-
资助金额:--
-
批准年份:2020
-
负责人:刘姝
-
依托单位:
HMX和TNT降低其CL-20共晶撞击点火条件的降感机理
-
批准号:12002325
-
项目类别:青年科学基金项目
-
资助金额:24.0万元
-
批准年份:2020
-
负责人:柴传国
-
依托单位:
钢渣碳酸化/水化产物中凝胶体和晶体比例及状态调控对其制品性能的影响机理
-
批准号:51972038
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:60.0万元
-
批准年份:2019
-
负责人:常钧
-
依托单位:
基于均匀化理论的多孔岩石循环荷载下破坏机制以及安定性研究
-
批准号:11902111
-
项目类别:青年科学基金项目
-
资助金额:24.0万元
-
批准年份:2019
-
负责人:张瑨
-
依托单位:
基于安定性理论的超大粒径块石土石混填路基力学特性研究
-
批准号:51978237
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:60.0万元
-
批准年份:2019
-
负责人:宋杨
-
依托单位: