Excited states of bio-molecules and their dynamics : Electronic-structure theoretical approach

生物分子的激发态及其动力学：电子结构理论方法

• 批准号: 18770130
• 负责人: HASEGAWA Jun-ya
• 金额: $ 2.36万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18770130/
• 关键词: 光生物学; 励起状態理論; QM; MM法; SAC-CI法; 生体分子; 光化学; 励起状態; 光合成反応中心; レチナールたんぱく質; 蛍ルシフェラーゼ; 励起生体分子; 電子状態理論

電子励起した生体分子がどのような挙動を示すかを研究するために、励起状態のポテンシャルエネルギー面を計算する方法を整備した。巨大な蛋白質-色素複合体を計算するために、量子-古典ハイブリッド法であるQM/MM 法のプログラムを開発した。その応用として、レチナール蛋白質、ホタルルシフェラーゼなどの励起状態を計算した。その結果、ヒト色覚で見られるレチナールのスペクトル制御メカニズムやホタルの黄緑色発光の起源などを明らかにし、人工的な発光色チュ-ニングの提案などを行った。また、ヘムにおける酸素分子吸着過程を明らかにした。

The method of calculation of excitation state The quantum and classical methods for calculating giant protein-pigment complexes were developed. The calculation of the excitation state of the protein, protein and protein is carried out in the same way as the calculation of the excitation state. The result of the test is that the color of the product is different from that of the original yellow and green light. The color of the product is different from that of the original yellow and green light. The absorption process of acid molecules is very clear.

项目成果

Charge-Polarized Coordination Space for H2 Adsorption

• DOI: 10.1021/cm802566z
• 发表时间: 2009-04
• 期刊: Chemistry of Materials
• 影响因子: 8.6
• 作者: J. Hasegawa;Masakazu Higuchi;Y. Hijikata;S. Kitagawa

SAC-CI applied to photobiology and biospectroscopy

SAC-CI应用于光生物学和生物光谱学

• 发表时间: 2006
• 作者: H.Nakashima;J.Hasegawa;H.Nakatsuji;長谷川淳也;長谷川淳也;J. Hasegawa;J. Hasegawa;J. Hasegawa;長谷川淳也;長谷川淳也;長谷川淳也;J. Hasegawa;J. Hasegawa;長谷川淳也;J. Hasegawa;J. Hasegawa;J. Hasegawa;J. Hasegawa;J. Hasegawa
• 通讯作者: J. Hasegawa

Spectral Tuning Mechanism in Photofunctional Proteins : A SAC-CI Theoretical Study

光功能蛋白的光谱调节机制：SAC-CI 理论研究

• 发表时间: 2008
• 期刊: Frontiers of Computational Science 2008 1
• 作者: J. Hasegawa;K. Fujimoto;N. Nakatani;H. NakatsUki
• 通讯作者: H. NakatsUki

Color-tuning in Photobiology: A SAC-CI study(招待講演)

光生物学中的色彩调节：SAC-CI 研究（特邀演讲）

• 发表时间: 2007
• 作者: H.Nakashima;J.Hasegawa;H.Nakatsuji;J. Hasegawa;長谷川淳也;J. Hasegawa;長谷川淳也;J. Hasegawa;J. Hasegawa;J. Hasegawa
• 通讯作者: J. Hasegawa

Theoretical studies on the color-tuning mechanism in retinal proteins

• DOI: 10.1021/ct6002687
• 发表时间: 2007-03-01
• 期刊: JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION
• 影响因子: 5.5
• 作者: Fujimoto, Kazuhiro;Hayashi, Shigehiko;Nakatsuji, Hiroshi
• 通讯作者: Nakatsuji, Hiroshi