ゲノム複製開始点の2重鎖DNAを特異的に開裂する蛋白質高次複合体のメカニズム

在基因组复制起点特异性切割双链 DNA 的高阶蛋白质复合物的机制

基本信息

  • 批准号:
    07J03615
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.22万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2007
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2007 至 2008
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

細胞生物のゲノム複製は複製開始点の2重鎖DNAを特異的に開裂することで開始される。この反応はイニシエーター蛋白質が複製開始点上で形成する動的な高次複合体中で起こる。この高次複合体の形成様式と構造変化を理解することは、ゲノム複製開始反応とその制御メカニズムを解明する上で非常に重要である。そこで研究代表者は2重鎖DNA開裂反応の普遍原理を明らかにすることを研究目的とし、特に当面の目標として、超好熱性真正細菌由来の開始蛋白質(tmaDnaA)と複製開始点(tma-oriC)とで形成される高次複合体の形成様式とその制御についての理解を目指した。(1)tmaDnaA多量体形成に必要なtma-oriC最小機能領域及び、機能構造の同定についてtma-oriC最小機能領域を決定し、oriC開裂の基本となるモデルを提唱した。研究代表者は本研究成果を第80回日本遺伝学会大会において発表し、Best Papers賞を受賞した。本研究内容は、現在論文投稿準備中である。(2)tmaDnaA多量体形成のためのDnaA間相互作用解析についてtmaDnaA多量体の構造モデルに基づいてDnaA間相互作用に重要と思われるアミノ酸残基を複数予測した。このアミノ酸残基に変異をそれぞれ導入し、tmaDnaA変異体を構築し、生化学的解析を進めた。いくつかの変異体は多量体形成能を欠損していた。(3)ATP結合依存のtmaDnaA構造変化様式の解析についてDNase Iフットプリント解析を用いて、ATP結合依存の構造変化をモニターする方法を構築した。いくつかのtmaDnaA変異体はATP依存の構造変化能を欠損した。
细胞生物的基因组复制是通过在复制的起源处特异性切割的双链DNA来启动的。该反应发生在动态的高阶复合物中,其中引发剂蛋白在复制的起源处形成。了解这种高阶复合物的形成模式和结构变化对于阐明基因组复制起始反应及其调节机制极为重要。因此,研究人员的研究旨在阐明双链DNA裂解反应的普遍原则,作为一个特定目标,他旨在了解启动蛋白(Tmadnaa)形成的高阶络合物(TMADNAA)的高阶模式和调节,并从高热粒细胞膜中产生的蛋白质(TMADNAA)和复制点(TMA-arivication)。 (1)我们确定了TMADNAA多聚体形成所需的最小TMA-oricor功能区域,以及用于功能结构鉴定的最小TMA-ORID功能区域,并提出了一个基本模型的Oric裂解模型。首席研究人员在日本遗传学协会第80届会议上介绍了研究结果,并获得了最佳论文奖。目前,这项研究正在准备提交论文。 (2)分析TMADNAA多聚体形成的DNAA相互作用,我们预测了几种氨基酸残基,这些氨基酸残基被认为对基于TMADNAA多组的结构模型而言对DNAA相互作用很重要。将突变引入每个这些氨基酸残基中,并构建了Tmadnaa突变体,并进行了生化分析。一些突变体缺乏多聚体的能力。 (3)使用DNASE I足迹分析来构建一种用于监测ATP结合依赖性结构变化的方法来构建一种方法。几个tmadnaa突变体缺乏依赖ATP的结构变化能力。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Role for the DnaA sensor 1 motif in the tight affinity for ATP/ADP
DnaA 传感器 1 基序在 ATP/ADP 紧密亲和力中的作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ozaki;et. al.
  • 通讯作者:
    et. al.
Analysis on the specific residues of DnaA protein for duplex unwinding during the initiation of chromosomal replication in Escherichia coli
大肠杆菌染色体复制启动过程中双链体解旋的 DnaA 蛋白特异性残基分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ozaki;et al.
  • 通讯作者:
    et al.
DnaAによる2重鎖開裂における複製起点の最小機能構造
DnaA 双链体切割中复制起点的最小功能结构
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    尾崎省吾;片山勉
  • 通讯作者:
    片山勉
A common role of the DUE binding activity of DnaA for the initiation of chromosomal replication
DnaA 的 DUE 结合活性在染色体复制启动中的常见作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ozaki;S. ほか
  • 通讯作者:
    S. ほか
DnaA結合因子DiaA蛋白質による複製開始の制御機構
DnaA 结合因子 DiaA 蛋白控制复制起始的机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    片山勉;毛谷村賢司;藤川乃り映;石田琢磨;尾崎省吾;末次正幸;藤光和之;香川亘;横山茂之;胡桃坂仁志
  • 通讯作者:
    胡桃坂仁志
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  • 影响因子:
    0
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  • 通讯作者:
    片山 勉
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    片山 勉;三善 賢弥;吉田 竜星;盧 楚元;李 藍楊;興梠 和真;辰本 優香;伊藤 孝輔;川上 広宣;加生 和寿;尾崎 省吾
  • 通讯作者:
    尾崎 省吾
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  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    尾崎 省吾;et. al.
  • 通讯作者:
    et. al.

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    $ 1.22万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

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    $ 1.22万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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  • 资助金额:
    $ 1.22万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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    17080005
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 1.22万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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