単一神経細胞マイクロアレイによる大脳皮質GABAニューロンの解析
使用单神经元微阵列分析大脑皮层 GABA 神经元
基本信息
- 批准号:18700320
- 负责人:
- 金额:$ 2.24万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份:2006
- 资助国家:日本
- 起止时间:2006 至 2007
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
我々はタカラバイオ社のSuper Smart cDNA PCR synthesis kitとAffymetrix社のOne cycle RNA labeling kitを組み合わせて行うことができる単一細胞マイクロアレイ法を開発した。この方法の再現性、信頼度を確かめるために、E18-P0のGAD67-GFPノックインマウスの大脳皮質よりGFP陽性細胞をセルソーターにより分離して得た1μgのtotalRNAからOne cycle RNA labeling kitでマイクロアレイ解析を行なった場合と、このtotalRNAを10万倍希釈してから我々が確立した方法で増幅を行なった場合の結果を比較したところ、希釈して増幅した場合は、約56%の遺伝子をPresent callとして検出することができた。この方法を用いて、10個のE18-P0のGAD67-GFPノックインマウスの大脳皮質の脳室下帯のGAD67陽性細胞の単一シングルセルマイクロアレイ解析を行ったところ、細胞ごとに異なった発現プロファイリングを得ることができた。この解析した細胞のDNA replication関連遺伝子群を調べたところ、1個の細胞において、たくさんのDNA replication関連遺伝子の発現を検出することができた。この細胞はDNA合成期にあったと考えられる。また、他の細胞においても、DNA replication関連遺伝子の一部の発現が認められたことから、この細胞はGO期にあってもまだ分裂能を秘めた細胞であった可能性が考えられる。これらの結果はGABAergic intermediate progenitorが脳室下帯に多く含まれていることを示唆している。
我们已经开发了一种单细胞微阵列方法,该方法可以与Takara Bio的Super Smart CDNA PCR合成套件和Affymetrix的一个周期RNA标记套件结合使用。为了验证该方法的可重复性和可靠性,我们使用一个周期RNA标记的KIT比较了微阵列分析的结果,该基数通过使用单元格和使用Tirme dire tir的时间来建立了100个GAD67-GFP敲击小鼠的E18-P0 GFP敲击小鼠的大脑皮层获得的GFP阳性细胞获得的总体,并通过使用该方法通过使用该方法来弥补了该方法,从而通过使用该方法来弥补了该方法,从而通过使用该方法来进行iNRNA,从而使我们使用该方法来建立了该方法,从而通过implife tire tir,通过使用该方法来建立了我们的方法,该方法是在E18-p0 GFP敲击小鼠的E18-P0 GFP敲击小鼠中,并通过使用该方法来进行了Atter,该方法是通过使用该方法来进行了。当稀释和扩增时,可以检测到约56%的基因作为当前调用。使用这种方法,进行了10 E18-P0 GAD67-GFP敲击小鼠的脑室皮层的GAD67阳性细胞的单细胞微阵列分析,并获得了每个细胞的不同表达分析。当检查了分析细胞的DNA复制相关基因组时,可以检测一个细胞中许多与DNA复制相关基因的表达。该细胞被认为处于DNA合成阶段。此外,由于在其他细胞中观察到了与DNA复制相关基因的一部分表达,因此即使在GO相期间,该细胞也可能仍然能够分裂。这些结果表明,脑室下区的GABA能中间祖细胞丰富。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The protocadherin-alpha family is involved in axonal coalescence of olfactory sensory neurons into glomeruli of the olfactory bulb in mouse.
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- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hasegawa,S.;Hamada,S.;Kumode,Y.;Esumi,S.;Katori,S.;Fukuda,E.;Uchiyama,Y.;Hirabayashi,T.;Mombaerts,P. Yagi,T
- 通讯作者:Mombaerts,P. Yagi,T
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