遺伝子及びシスト化石情報の統合化による渦鞭毛藻類の進化過程の解明
遺伝子及びシスト化石情報の統合化による渦鞭毛藻類の進化過程の解明
批准号:
18740325
负责人:
河村 裕
金额:
$2.3万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007
中文摘要
本研究の目的は下記の5点の達成である。(1)シストを形成するProtoperidinium種のシストー遊泳細胞関係を検証する。(2)シスト形態および分子系統学的手法を用い現存の分類体系を統括的に検証する。(3)分子系統学手法にて得られた系統関係をシスト化石の記録と比較しProtoperidiniumの進化過程・起源を解明する。(4)得られた進化過程を現存する古環境データと比較して環境変動-進化過程関係を推測する。本年度研究では目標(1)及び(2)の達成を目指した。目標(1)の達成のために現在までに日本で確認されているシスト種中6種の発芽実験を行った。その結果現在知られているシスト-遊泳細胞関係は大まかに正しいことが判明した。しかしその中のシスト種1種については現在シスト発芽口の形が3種類あることが知られており、その中の2種類のシストの採集に成功しSSU・RNA配列を調べ比較した。その結果この2種類にはDNA配列に違いがあることが確認されシスト発芽口の形がその2種類を分類する際に有意義であるという結論に至った。目標(2)の達成のためにシスト形成種8種を含む計18種のLSUまたはSSU RNA配列を調べその系統樹を作成した。その系統樹によるとシスト非形成種は派生的に出現しており、全体をみた場合シスト形成種が祖先的であるという可能性を示唆した。しかし、現在までに調べた種数は少なすぎであり、この説を確固とするためにはより多くの種の分子配列を調べなければ成らないという結論に達した。
英文摘要
本研究の目的は下記の5点の達成である。(1)シストを形成するProtoperidinium種のシストー遊泳細胞関係を検証する。(2)シスト形態および分子系統学的手法を用い現存の分類体系を統括的に検証する。(3)分子系統学手法にて得られた系統関係をシスト化石の記録と比較しProtoperidiniumの進化過程・起源を解明する。(4)得られた進化過程を現存する古環境データと比較して環境変動-進化過程関係を推測する。本年度研究では目標(1)及び(2)の達成を目指した。目標(1)の達成のために現在までに日本で確認されているシスト種中6種の発芽実験を行った。その結果現在知られているシスト-遊泳細胞関係は大まかに正しいことが判明した。しかしその中のシスト種1種については現在シスト発芽口の形が3種類あることが知られており、その中の2種類のシストの採集に成功しSSU・RNA配列を調べ比較した。その結果この2種類にはDNA配列に違いがあることが確認されシスト発芽口の形がその2種類を分類する際に有意義であるという結論に至った。目標(2)の達成のためにシスト形成種8種を含む計18種のLSUまたはSSU RNA配列を調べその系統樹を作成した。その系統樹によるとシスト非形成種は派生的に出現しており、全体をみた場合シスト形成種が祖先的であるという可能性を示唆した。しかし、現在までに調べた種数は少なすぎであり、この説を確固とするためにはより多くの種の分子配列を調べなければ成らないという結論に達した。
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会议论文
Further molecular phylogenetic study of heterotrophic dinoflagellate genus, Protoperidinium based on SSU and LSU ribosomal RNA gene sequences
基于SSU和LSU核糖体RNA基因序列的异养甲藻属Protoperidinium的进一步分子系统发育研究
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Phycological Research 54
影响因子:
--
作者:
[Yamaguchi, A.]
通讯作者:
A.
The phylogenetic position of an unusual Protoperidiniuum sp. P. bipes
一种不寻常的 Protoperidiniuum sp 的系统发育位置。
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Phycologia
影响因子:
1.6
作者:
[Yamaguchi, A.]
通讯作者:
A.
ShearStress存在下における癌細胞着床現象の動的解析
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批准号:11671154
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.24万
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财政年份:1999
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负责人:河村 裕
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依托单位: