Elucidation of Light-Induced Entrain Mechanism of Circadian Rhythms with the Approach of Systems Biology

用系统生物学的方法阐明光诱导昼夜节律的机制

• 批准号: 19300103
• 负责人: MATSUNO Hiroshi
• 金额: $ 3.74万
• 依托单位: Yamaguchi University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19300103/
• 关键词: システム生物学; シミュレーション; 概日リズム; 光同調; 遺伝子ネットワーク; ハイブリッド関数ペトリネット; 時計遺伝子; ペトリネット

光同調は光誘導されるPer遺伝子の増加でもたらされるが、この増加が一定のモデルと主観的昼に増加しない時刻依存的モデルについてシミュレーションを行い、後者のモデルが光同調により適していることを示した。応用例として時差症候群を取り扱い、移動先の日周環境への同調に至るまでの光による位相変化が遺伝子レベルで説明できることを示した。さらに新しく時計遺伝子としての役割が確認されたRor遺伝子の働きをモデルに組み込み、振動の頑健さ維持に必要なRor遺伝子産物が関わる分子作用の存在について未発見の知見を得た。

The increase of photocoherence induced by light is due to the increase of photocoherence induced by light. The increase of photocoherence induced by light is due to the increase of photocoherence induced by light. For example, the time difference syndrome is selected from the group consisting of: In addition, the new timing mechanism of Ror gene has been confirmed, and the molecular interaction between Ror gene and Ror gene has not been discovered yet.

项目成果

哺乳類生物時計における遺伝子転写調節のペトリネットモデル

哺乳动物生物钟基因转录调控的Petri网模型

• 发表时间: 2008
• 作者: Yoshihiro Nakajima;他5名;坪郷英彦;高橋征仁;宮本賢志
• 通讯作者: 宮本賢志

システム生物的アプローチによるマウス概日リズムの遺伝子発現位相パターンの理解

使用系统生物学方法了解小鼠昼夜节律的基因表达相位模式

• 发表时间: 2007
• 作者: 田中優子;横尾英明;新井基展;大澤匡;平戸純子;鈴木豊;好本裕平;中里洋一;松井 明生
• 通讯作者: 松井 明生

哺乳類生物時計における遺伝子調節のペトリネットモデル

哺乳动物生物钟基因调控的Petri网模型

• 发表时间: 2008
• 作者: 宮本賢志;松野浩嗣;井上愼一
• 通讯作者: 井上愼一

リカレントニューラルネットワークによる細胞内反応経路の脆弱・頑健部位の推定手法

使用循环神经网络估计细胞内反应途径的弱部分和强部分的方法

• 发表时间: 2008
• 期刊: 電子情報通信学会論文誌D分冊 J91-D
• 作者: 河合真梨子;福和伸夫;他;北風裕教
• 通讯作者: 北風裕教

Simulation analysis for the effect of light-dark circadian rhythms

明暗昼夜节律影响的模拟分析

• 发表时间: 2008
• 期刊: Genome Informatics Vol.20
• 作者: N. Mitou;Y. Ikegami;H. Matsuno;S. Miyano;S. T. Inouye
• 通讯作者: S. T. Inouye