Molecular mechanism for the accurate recognition of homologous sequences

同源序列准确识别的分子机制

• 批准号: 19370004
• 负责人: SHIBATA Takehiko
• 金额: $ 11.56万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19370004/
• 关键词: ゲノム構築・機能・再編・発現・維持; 相同DNA組換え; RecA; Rad51型相同対合蛋白質; ATP非依存型相同DNA対合蛋白質; 組換えメディエーター; ヘテロ二重鎖形成; 並行三重鎖DNA; DNAトポロジー; Rad51型相同的対合蛋白質; 相同DNA組換え酵素; Recombinase

Homologous DNA recombination plays roles in the maintenance of genome integrity and in genetic diversification. While RecA/Rad51 homologous pairing proteins pairs DNA molecules with an exact sequence matching by an ATP-hydrolysis-dependent reaction, ATP-independent pairing proteins is unlikely to have such a function. To understand the molecular bases of the recombination functions, we compared RecA/Rad51 and ATP-independent homologous pairing proteins in their reactions. NMR analyses indicate that basic mechanisms of homologous pairing are common independent of the proteins. On the other hand, biochemical and topological studies suggest that an ATP-independent protein generates triplexes, instead of D-loops which RecA/Rad51 produces. These results suggest roles of the two groups of the proteins in homologous recombination.

同源DNA重组在维持基因组完整性和遗传多样性方面发挥着重要作用。虽然RecA/Rad51同源配对蛋白通过atp水解依赖性反应将DNA分子与精确序列匹配，但atp非依赖性配对蛋白不太可能具有这样的功能。为了了解重组功能的分子基础，我们比较了RecA/Rad51和atp非依赖性同源配对蛋白的反应。核磁共振分析表明，同源配对的基本机制是共同的，独立于蛋白质。另一方面，生物化学和拓扑学研究表明，与atp无关的蛋白质产生三联体，而不是RecA/Rad51产生的d环。这些结果提示了两组蛋白在同源重组中的作用。

项目成果

相同的DNA組換え反応を調節する組換えメディエーター蛋白質群の構造と機能

调节同源 DNA 重组反应的重组介体蛋白的结构和功能

• 发表时间: 2008
• 作者: Kurokawa Y;Murayama Y;Haruta-Takahashi N;Urabe I;Iwasaki H.;美川務
• 通讯作者: 美川務

Rad52の立体構造に基づく相同DNA組換え反応機構の解析

基于Rad52三维结构分析同源DNA重组反应机理

• 发表时间: 2008
• 作者: Hayakawa Y;Nakauchi U;Munehara H,Kobayashi M;Watanabe A;Onitake K;岩崎博史;Iwasaki H.;香川亘
• 通讯作者: 香川亘

Role of RecF, RecO, RecR proteins in SSB displacement from sin-gle-stranded DNA

RecF、RecO、RecR 蛋白在单链 DNA 的 SSB 置换中的作用

• 发表时间: 2007
• 作者: Mikawa;T.
• 通讯作者: T.

Analysis of DNA-binding sites on Mhr1, a yeast mitochondrial ATP-independent homologous pairing protein

Mhr1（一种酵母线粒体 ATP 依赖性同源配对蛋白）上的 DNA 结合位点分析

• 发表时间: 2010
• 期刊: FEBS Journal 277
• 作者: Tokiha Masuda;Feng Ling;Takehiko Shibata;Tsutomu Mikawa
• 通讯作者: Tsutomu Mikawa

RecO,RecR蛋白質によるSSBのssDNAからの解離のメカニズム

RecO 和 RecR 蛋白将 SSB 从 ssDNA 上解离的机制

• 发表时间: 2008
• 作者: Saito K.;et. al.;Jin Inoue;Jin Inoue;Kaori Kurashima-Ito;井上 仁
• 通讯作者: 井上 仁