Analysis of within-patient HIV-1 evolution and drug resistance mechanismsunder anti-HIV therapy
Analysis of within-patient HIV-1 evolution and drug resistance mechanismsunder anti-HIV therapy
批准号:
19510208
负责人:
REN Fengrong
金额:
$2.58万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008
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英文摘要
HIV宿主内進化過程を推定するための計算アルゴリズムvSPAを開発した。AIDS患者2症例から経時的に得られた1000個近いHIV-1サンプルへ適用した結果、薬剤耐性獲得に関連する突然変異などを検出することができた。バイオインフォマティクス手法を用いて、抗HIV剤治療を受けた1症例より経時的に採取したHIV-1サンプルから、GagとPR遺伝子間の共進化突然変異を推定した。さらにin vitro実験を行い、これらの同時変異が機能的に有意であることを確認した。
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会议论文
Gag and protease co-evolution inan antiretroviral treatment failure case. 8th Annual Symposium on Antiviral Drug Resistance
抗逆转录病毒治疗失败案例中的 Gag 和蛋白酶共同进化。
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shibata J, Ren F, Nishizawa M, Tsang H,Iwatani Y, Matsuda M, Miura H, Tanaka H,Sugiura W]
通讯作者:
Tanaka H,Sugiura W
HIV-1 env遺伝子の多様性進化
HIV-1 env基因多样性进化
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[吉田いづみ, 西澤雅子, 藤野真之, 仲宗根正, 岩谷靖雅, 長谷川直紀, 柴田潤子, 杉浦亘, 任鳳蓉, 田中博]
通讯作者:
田中博
INFERENCE OF EVOLUTIONARY CHANGES OF WITHIN-HOST VIRUS
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批准号:15510157
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:2003
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负责人:REN Fengrong
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依托单位:
A New Algorithm for Analysis of Within-host Viral Evolution
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批准号:13680758
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:2001
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负责人:REN Fengrong
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依托单位: