Practical application of permutation test to genomewide associationstudy

排列检验在全基因组关联研究中的实际应用

• 批准号: 19590332
• 负责人: YAMADA Ryo
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19590332/
• 关键词: 遺伝学; 統計数学; ゲノム; パーミュテーションテスト; 一塩基多型; マルチプルテスティング

ゲノムワイド疾患関連解析における統計検定上の実用的問題のひとつである多重検定問題を対象に、それをパーミュテーションテストを用いて補正するアプリケーションを実装し、公開した。

The problem of statistical identification of the disease is solved by the method of multiple identification of the disease.

项目成果

SLC22A4Polymorphism and Rheumatoid ArthritisSusceptibility : A Replication Study in a Japanese Population and a Metaanalysis

SLC22A4多态性和类风湿性关节炎易感性：日本人群的复制研究和荟萃分析

• 发表时间: 2008
• 期刊: J Rheumatol 35(9)
• 作者: Okada Y;Mori M;Yamada R;Suzuki A,Kobayashi K;Kubo M;Nakamura Y,Yamamoto K.
• 通讯作者: Nakamura Y,Yamamoto K.

Primer:SNP-associated studies and whay they can teach us.

入门读物：SNP 相关研究以及它们可以教给我们什么。

• 发表时间: 2008
• 期刊: Nature clinical practice 4
• 作者: 小西真紀子;柳田梨沙;成瀬妙子;中島敏晶;照沼裕;三間屋純一;木村彰方;Yamada R.
• 通讯作者: Yamada R.

Primer: SNP-associated studies and what they can teach us

• DOI: 10.1038/ncprheum0757
• 发表时间: 2008-04
• 期刊: Nature Clinical Practice Rheumatology
• 作者: R. Yamada

ManganeseSuperoxide Dismutase Gene (SOD2)Polymorphism and Exudative Age-relatedMacular Degeneration in the apanese Population

日本人群锰超氧化物歧化酶基因（SOD2）多态性与渗出性年龄相关性黄斑变性

• 发表时间: 2008
• 期刊: Am J Ophthalmol 146(1)
• 作者: Gotoh N;Yamada R;Matsuda F,Yoshimura N;Iida T.
• 通讯作者: Iida T.

A single nucleotide polymorphism in the IRF5 promoter region is associated with sus=

IRF5 启动子区域的单核苷酸多态性与 sus= 相关

• 发表时间: 2008
• 期刊: Annals of the rheumatic diseases. 40(e-pub)
• 作者: Shimane;K.;Kochi,Y.;Yamada;l
• 通讯作者: l