Comprehensive analysis of gene expression in malignant mesothelioma using Affymetrix GeneChip array

使用 Affymetrix GeneChip 芯片综合分析恶性间皮瘤的基因表达

• 批准号: 19590350
• 负责人: AMATYA Vishwaj
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19590350/
• 关键词: 中皮腫; 遺伝子発現; GeneChip; マイクロアレイ; Genechip; メチル化

凍結材料を用いた研究では、中皮腫と肺腺癌の間で統計学的有意差を持って発現異常のみられる遺伝子のクラスター化を行い、中皮腫では肺腺癌と比較して、231遺伝子の過剰発現、64遺伝子の発現低下が見られた。FFPE材料を用いた研究では、中皮腫と非腫瘍肺組織の間で統計学的に有意差をもって発現異常の見られる遺伝子のクラスター化を行い、中皮腫では266遺伝子の過剰発現と948遺伝子の発現低下があることが判明した。過剰発現のある遺伝子には、Calbindin2(Calretinin)、Keratin5、PDGF、Ki-67などが含まれ、ホルマリン固定パラフィン包埋材料からでも十分に遺伝子異常の有無を検討できることがわかった。これらの遺伝子の中でReal Time定量RT-PCR法にて、NDRG-1、RARRES-1及びHAS-1遺伝子のmRNAの発現が非腫瘍肺組織と比べ中皮腫には過剰であることが判明した。また、Wnt-signal経路に関する遺伝子では、WIF1、MMP7、β-cateninなどの発現低下とCaM kinase、Nemo-like Kinaseなどの過剰発現を認めた。メチル化及び非メチル化特異的プライマーを用いたMethylation Specific PCRでは、中皮腫の76%と非腫瘍性肺組織の32%にはWIF-1プロモーター領域のメチル化を認め、WIF-1の発現減少はメチル化によるものと考えた。

The statistical significance of frozen material in the study of lung adenocarcinoma and mesothelioma was significantly higher than that in the study of lung adenocarcinoma and mesothelioma. FFPE material was used in the study of the statistical differences between lung tissue, mesothelioma and non-cancerous lung tissue. The presence or absence of abnormal genes in the embedded material is discussed. The mRNA expression of NDRG-1, RARRES-1 and HAS-1 genes in lung tissue was identified by quantitative RT-PCR. The expression of Wnt-signal-related proteins, WIF-1, MMP-7, β-catenin, CaM kinase and Nemo-like Kinase is low. WIF-1 was detected in 76% of lung tissues and 32% of non-cancerous lung tissues. WIF-1 was detected in 76% of lung tissues and 32% of non-cancerous lung tissues.

项目成果

中皮腫発生に関わるエピジェネティクス

表观遗传学参与间皮瘤的发展

• 发表时间: 2009
• 期刊: MOOK「肺癌の臨床2008~2009」
• 作者: 河野秀和;Amatya VJ;武島幸男;井内康輝
• 通讯作者: 井内康輝

Caveolin-1 is a novel immunohistochemical marker to differentiate epithelioid mesothelioma from lung adenocarcinoma

Caveolin-1 是一种新型免疫组织化学标记物，用于区分上皮样间皮瘤和肺腺癌

• 发表时间: 2009
• 期刊: Histopathology 55
• 作者: Amatya VJ;Takeshima Y;Kohno H;Kushitani K;Yamada T;Morimoto C;Inai K.
• 通讯作者: Inai K.

中皮腫の遺伝子異常-マイクロアレイを用いた網羅的解析

间皮瘤的遗传异常 - 使用微阵列进行综合分析

• 发表时间: 2007
• 期刊: MOOK「肺癌の臨床2007~2008」
• 作者: Amatya VJ;武島幸男;井内康輝
• 通讯作者: 井内康輝

Caveolin-1 is a novel immunohistochemical marker of malignant mesothelioma and differentiated epithelioid mesothelioma from lung adenocarcinoma

Caveolin-1 是恶性间皮瘤和肺腺癌分化上皮样间皮瘤的新型免疫组织化学标记物

• 发表时间: 2008
• 作者: Amatya VJ;Takeshima Y;Kohno H;Kushitani K;Yamada T;Morimoto C and Inai K
• 通讯作者: Morimoto C and Inai K

Caveolin-1 (CAV1) is novel marker of epithelioid mesothelioma (EM) for differentiating it from lung adenocarcinoma (LAC)

Caveolin-1 (CAV1) 是上皮样间皮瘤 (EM) 的新标志物，用于区分肺腺癌 (LAC)

• 发表时间: 2008
• 作者: Vishwa Jeet Amatya;河野秀和;櫛谷桂;武島幸男;井内康輝
• 通讯作者: 井内康輝