Development of novel compound of function selective labeling reagent for proteins and its systematic use

新型蛋白质功能选择性标记试剂化合物的研制及其系统应用

• 批准号: 19685015
• 负责人: HINOU Hiroshi
• 金额: $ 8.57万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19685015/
• 关键词: 自殺基質; 機能選択的; 特異的阻害; 触媒部位の同定; ラベル化; 非特異的阻害; 活性化速度; シアリダーゼ; 阻害剤; 特異性; 分子設計; 環状構造; 機能選択的ラベル化; 活性加速度

I have tried to develop a novel method of inhibitor design of such enzymes exemplified to a neuraminidase Vibrio cholerae neuraminidase (VCNA) of which crystal structure was reported in 1994 and most potent inhibitor was reported in 1971. As a result, a potent inhibitor for Vibrio cholerae neuramnidase was developed using mechanism-based labeling information of key amino acid residues, design of a skeleton of focused library based on labeling information, screening of the focused library, and elimination of promiscuous inhibitor by detergent-based assay to afford potent (Ki=73nM) and selective inhibitor among viral, bacterial, and mammal neuraminidases.

我试图开发一种新的设计这类酶的抑制剂的方法，例如一种神经氨酸酶霍乱弧菌神经氨酸酶(VCNA)，其晶体结构于1994年被报道，最有效的抑制剂在1971年被报道。因此，通过对霍乱弧菌神经氨酸酶关键氨基酸残基的机理标记信息、基于标记信息的聚焦文库骨架的设计、聚焦文库的筛选和基于洗涤剂的杂乱抑制物筛选，开发了霍乱弧菌神经氨酸酶的有效抑制物，以获得病毒、细菌和哺乳动物神经氨酸酶的有效和选择性抑制物(Ki=73 nM)。

项目成果

フォーカスドライブラリーを用いた特異的シアル酸転移酵素阻害剤の探索

使用聚焦库搜索特定的唾液酸转移酶抑制剂

• 发表时间: 2008
• 作者: 細口健作;古川潤一;前田哲宏;比能洋;西村紳一郎
• 通讯作者: 西村紳一郎

Structural analysis of O-glycopeptides employing negative- and positive-ion MSn spectra obtained by collision-induced and electron-capture dissociations in linear ion trap time-of-flight mass spectrometry

利用线性离子阱飞行时间质谱中碰撞诱导和电子捕获解离获得的负离子和正离子 MSn 光谱对 O-糖肽进行结构分析

• 发表时间: 2007
• 期刊: Rapid Commun. Mass Spectrom. 21
• 作者: Kisaburo Deguchi;Hiroki Ito;Takashi Baba;Atsushi Hirabayashi;Hiroaki Nakagawa;Masataka Fumoto;Hiroshi Hinou;Shin-Ichiro Nishimura
• 通讯作者: Shin-Ichiro Nishimura

自殺基質型酵素プローブを用いたVibrio cholerae neuraminidase阻害剤の開発

使用自杀底物型酶探针开发霍乱弧菌神经氨酸酶抑制剂

• 发表时间: 2009
• 作者: 比能洋;三好利尚;高須康明;甲斐宏一;西村紳一郎
• 通讯作者: 西村紳一郎

Highly efficient synthesis of versatile proteoglycan core structures from 1, 6-anhydro- β-lactose as a key starting material

以 1, 6-脱水-β-乳糖为关键起始原料高效合成多功能蛋白聚糖核心结构

• 发表时间: 2007
• 期刊: Angew. Chem. Int. Ed. 46
• 作者: Ken Shimawaki;Yoshinori Fujisawa;Fumihiro Sato;Naoki Fujitani;Masaki Kurogochi;Hiroko Hoshi;Hiroshi Hinou;Shin-Ichiro Nishimura
• 通讯作者: Shin-Ichiro Nishimura

Development of Novel Sialidase Suicide Substrate

新型唾液酸酶自杀底物的研制

• 发表时间: 2010
• 作者: 甲斐宏一;比能洋;西村紳一郎
• 通讯作者: 西村紳一郎