Distribution and importance of extracellular DNA in the subsurface sediments

地下沉积物中细胞外 DNA 的分布和重要性

• 批准号: 19740315
• 负责人: TAKEUCHI Mio
• 金额: $ 2.09万
• 依托单位: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19740315/
• 关键词: 細胞外DNA; 地下圏微生物; RNA; 古細菌; 微生物相; 陸域地下圏; 微生物相解析; 嫌気的メタン酸化; 粘土層; 炭素循環; 地球化学; 大深度地下; 核酸; 微生物; 堆積物

Extracellular DNA was quantified with terrestrial subsurface sediments. Extracellular DNA was detected at 2.9-28.3 ng/g dry weight sediment and decreased with depth. Microbial community analysis using the extracellular DNA yielded significantly low number of OTUs, suggesting that the extracellular DNA was fragmented or damaged in the environment. RNA based community analysis revealed variety of active microbes (Proteobacteria, Chloroflexi, Acidobacteria, Miscellaneous Crenarchaeotic Group (MCG), ANME) in the terrestrial subsurface environment.

胞外DNA定量与陆地地下沉积物。检测到的细胞外DNA含量为2.9-28.3纳克/克沉积物干重，并随深度增加而减少。使用胞外DNA的微生物群落分析产生显著低数量的OTU，表明胞外DNA在环境中被片段化或损坏。基于RNA的群落分析显示，在陆地地下环境中的活性微生物（变形菌，绿弯曲菌，酸杆菌，杂项Crenarchaeotic组（MCG），ANME）的多样性。

项目成果

Living microbial community (methanogens) in ancient marine sediments of Holocene in the Kanto Plain, Japan

日本关东平原全新世古代海洋沉积物中的活微生物群落（产甲烷菌）

• 发表时间: 2008
• 作者: Mio Takeuchi;Hideyuki Tamaki;Susumu Tanabe;Mieko Uchiyama;Maki Sugihara;Manabu Takahashi;Hideyoshi Yoshioka
• 通讯作者: Hideyoshi Yoshioka

Living microbial community (methanogens) in ancient marine sediments of Holocene in the Kanto Plain

关东平原全新世古代海洋沉积物中的活微生物群落（产甲烷菌）

• 发表时间: 2008
• 作者: M. Takeuchi;H. Tamaki;S. Tanabe;M. Uchiyama;M. Sugihara;M. Takahashi;H. Yoshioka
• 通讯作者: H. Yoshioka

地下圏微生物活動に対する難透水層の役割

防渗层对地下微生物活动的作用

• 发表时间: 2007
• 期刊: 地学雑誌 vol.116,no.6
• 作者: Mio Takeuchi;et al;竹内美緒
• 通讯作者: 竹内美緒

地下微生物研究の地圏環境修復への応用

地下微生物研究在地质环境修复中的应用

• 发表时间: 2007
• 期刊: Green Report 2007(地圏資源環境研究部門成果報告)
• 作者: Mio Takeuchi;et al;竹内美緒;竹内 美緒
• 通讯作者: 竹内 美緒

Microbial World in the Subsurface of Tokyo

东京地下的微生物世界

• 发表时间: 2009
• 作者: Mio Takeuchi;et al;竹内美緒;竹内 美緒;竹内 美緒;Mio Takeuchi;竹内美緒
• 通讯作者: 竹内美緒