Developing a parametric method to detect complex disease genes via a novel definition of interaction among genes

通过基因间相互作用的新定义开发参数化方法来检测复杂的疾病基因

• 批准号: 19790247
• 负责人: MANO Shuhei
• 金额: $ 0.93万
• 依托单位: Nagoya City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19790247/
• 关键词: 遺伝疫学; 統計遺伝学; 集団遺伝学; 遺伝子間相互作用; ランダムグラフ

浸透率行列のみで決まる遺伝子間相互作用のパラメタを定義した。既存の連鎖解析の枠組みである分離比分析の検出力は低く、家系の収集の困難を考慮すると、分離比分析は実用的でないことが分かった。そこで、ランダムグラフに基づく隠れマルコフモデルによりゲノムの各点における個体間のIBDを推定することで、家系が未知の標本であっても連鎖解析を可能にする手法を開発し、ソフトウェアに実装した。この手法は、ランダムサンプルについては、標本と両親のマーカーの情報を用いる通常の連鎖解析よりも高い検出力をもつことが分かった。遺伝子間相互作用の検出には実装している尤度を拡張する必要がある。その基礎となるランダムグラフの性質を考察した。

Permeability matrix determination and particle interaction definition The segregation ratio analysis of existing genetic linkage groups is difficult to consider, and the segregation ratio analysis is useful. For example, if a gene is linked to a gene, the gene may be linked to a gene. This technique is usually used for genetic linkage. The interaction between the molecules is necessary for the development of the molecule. A study of the nature of the foundation

项目成果

多因子病の統計解析のためのancestral random graph

用于多因素疾病统计分析的祖先随机图

• 发表时间: 2008
• 作者: Mano;S.;間野修平
• 通讯作者: 間野修平

Detecting linkage between a trait and a marker in a random mating population without pedigree record

在没有谱系记录的随机交配群体中检测性状和标记之间的联系

• 发表时间: 2009
• 期刊: Detecting linkage between a trait and a marker in a random mating population without pedigree record. PLoS ONE 4(3)
• 作者: Mano S;Endo TA;Oka A;Ozawa A;Gojobori T;Inoko H.
• 通讯作者: Inoko H.

FPL法を実装したソフトウェア

实现FPL方法的软件

事後同祖性に基づく集団を用いた連鎖解析

基于后同源论的群体连锁分析

• 发表时间: 2007
• 作者: Mano;S.;間野修平;間野修平;間野修平
• 通讯作者: 間野修平

Duality, ancestral and diffusion processes in models with selection

• DOI: 10.1016/j.tpb.2009.01.007
• 发表时间: 2009-03-01
• 期刊: THEORETICAL POPULATION BIOLOGY
• 影响因子: 1.4
• 作者: Mano, Shuhei