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有毒ラン藻感染性新規ファージの宿主増殖制御機構の解明

阐明感染有毒蓝绿藻的新型噬菌体的宿主生长控制机制

基本信息

批准号：
15J03247
负责人：
中村銀士
金额：
$ 1.22万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2015
资助国家：
日本
起止时间：
2015-04-24 至 2017-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15J03247/
关键词：
藍藻ファージアオコ

项目摘要

本年度、本研究員は①アオコ形成ラン藻Microcystisの成長阻害を引き起こすファージのゲノム解析と②メタゲノム解析を用いたアオコ環境中のファージ多様性および群集組成の解明を行った。①ファージのゲノム性状を明らかにするためにキサントゲンサン-SDS法によりゲノムを抽出し、得られたゲノムを次世代シーケンサーMiSeqに供した。得られたリードに対して解析ソフトVelvetおよびGlimmerを用いてORF(Open Reading Frame)を推定した。ORFをNCBIのnrデータベースに対する相同性検索を行うことで機能推定を行った。ゲノム解析の結果、本ファージは約86 kbのゲノムおよび141個のORFを有していた。141個のORFのうち84個はデータベース上の配列と相同性を示さず、残り57個の多くも相同性が低かった。したがって、本ファージは既知のファージとは全く異なるゲノムを有すると考えられた。②2013年10月の島根県宍道湖、2015年9月京都府広沢池、2015年9月滋賀県琵琶湖(北山田港、雄琴港)、2015年9月三重県青蓮寺湖および2015年10月茨城県霞ヶ浦から環境試水を採取し、採取した試水からファージDNAを抽出しMiSeqを用いてメタゲノム解析を行った。全6地点から1,695,896～11,844,490 個のリードが得られ、リードの7.6～15.5%がデータベース上の既知ファージと相同性(E-value >10-５)示した。このうちラン藻感染性ファージ(シアノファージ)と相同性を示したリードの割合は13.5～49 %だった。アオコが発生していない淡水域ではシアノファージの割合は5％未満であり、アオコ環境中ではシアノファージが主要構成種であることが示唆された。しかしながら、シアノファージと相同性を示したリードのほとんどは海洋性シアノファージと相同性を示し、アオコ環境中にはいまだ分離例の無い多様な淡水性シアノファージが存在すると示唆された。

This year, in this year, the staff of this study are responsible for the growth and prevention of Microcystis. 2. This year, the staff of this study are responsible for the growth of algae. The main results are as follows: (1) the trait is known to have been extracted by the SDS method, and the next generation has been obtained in the next generation. You can use the ORF (Open Reading Frame) presumption to parse the Velvet Glimmer. The ORF NCBI nr information system is capable of presuming that the line is related to the same line. According to the results of the analysis, there are about 86 kb