光合成オルガネラの初期進化における遺伝子の機能的転移メカニズムの解析

点击翻译按钮获取中文摘要

本研究計画では、初年度は、有殻アメーバ Paulinella chromatophoraのTBPとTFIIBに対する特異抗体を作成し、次いで、それらの抗体を用いた転写開始複合体の単離精製法の検討を進める予定であった。しかし、予想に反して、以前より進めていた同生物のゲノム解析と遺伝子群のアノテーションが、最終段階で難航した。主な原因は、ゲノムサイズが1GBと、10ー20μmの原生生物としては異常に大きいことと、そのゲノムの8割以上が何らかの反復配列で構成されているという特異なゲノム構造のためである。しかし、このゲノムにコードされている遺伝子群のアノテーション情報の整備は、上記抗体の作成や、次年度以降の基本転写因子群の同定にとっても前提となるので、当初予定を若干修正して、28年度は、有殻アメーバ P. chromatophoraのゲノムにコードされている遺伝子群の網羅的予測とスプライシングリーダー型のトランススプライシングが起きていることの証明を分子生物学的な手法を用いて解析することを行なった。遺伝子群のアノテーションは最終的に約3万7000個の重複のない有殻アメーバ遺伝子群の予想に成功した。これにより、抗体の作成、基本転写因子群の同定の研究に展開できる。また、スプライシングリーダー型のトランススプライシング機構は、この生物の遺伝子群の転写・発現制御様式を解明する上で、重要な情報になると考えられる。