The second ATP-binding site of the chaperonin GroEL and its functional role

伴侣蛋白 GroEL 的第二个 ATP 结合位点及其功能作用

• 批准号: 20370066
• 负责人: KUWAJIMA Kunihiro
• 金额: $ 13.23万
• 依托单位: National Institutes of Natural Sciences Okazaki Research Facilities
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20370066/
• 关键词: 分子シャペロン; シャペロニン; ATP結合; アロステリック転移; 生物物理; 分子機械; 分子認識; 生体分子; 蛋白質

The Escherichia coli chaperonin GroEL, a molecular chaperone that mediates protein folding in the biological cell, expresses its chaperone function through ATP binding. In the present study, we investigated the ATP binding to GroEL by photo-affinity labeling, amino acid sequence analysis, stopped-flow fluorescence spectroscopy, and isothermal titration calorimetry. We found (1) that the second ATP-binding site is present and located near Tyr360, and (2) that in the absence of potassium ion, only the ATP binding to the primary site was observed, and its binding constant is an order of 10^4M^<-1>.

大肠杆菌伴侣蛋白GroEL是一种介导生物细胞中蛋白质折叠的分子伴侣，通过ATP结合表达其伴侣蛋白功能。在本研究中，我们研究了ATP结合GroEL的光亲和标记，氨基酸序列分析，停流荧光光谱，等温滴定量热法。我们发现：（1）在Tyr 360附近存在第二个ATP结合位点;（2）在无钾离子存在的情况下，只观察到ATP与第一个位点的结合，其结合常数为10^4M^<-1>。

项目成果

Flexible Recognition of the tRNA G18 Methylation Target Site by TrmH Methyltransferase through First Binding and Induced Fit Processes

• DOI: 10.1074/jbc.m109.065698
• 发表时间: 2010-03-19
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Ochi, Anna;Makabe, Koki;Hori, Hiroyuki
• 通讯作者: Hori, Hiroyuki

何がタンパク質のフォールディング経路を決めるのか?

是什么决定了蛋白质折叠途径？

• 发表时间: 2010
• 期刊: MedicalBio(オーム社)
• 作者: T.Obayashi;K.Kinoshita;Ogawara D;中村敬
• 通讯作者: 中村敬

Solution-phase H/D exchange coupled with FT-ICR MS to probe conformational dynamics of the ATP-dependent chaperone, GroEL

溶液相 H/D 交换与 FT-ICR MS 结合探测 ATP 依赖性分子伴侣 GroEL 的构象动力学

• 发表时间: 2011
• 作者: Q.Zhang;H.-M.Zhang;J.Chen;M.R.Emmett;C.L.Hendricksonl;K.Kuwajima A.G.Marshall
• 通讯作者: K.Kuwajima A.G.Marshall

蛋白質フォールディング問題とバイオサイエンス

蛋白质折叠问题和生物科学

• 发表时间: 2010
• 作者: 木寺詔紀;森次圭;松永泰佑;藤崎弘士;Ashwini Patil;愿山郁;K.Kuwajima;Hiromitsu Shimoyama;真木寿治;桑島邦博
• 通讯作者: 桑島邦博

Molecular mechanisms of protein folding," 2010 Annual Meeting of Asian CORE Program "Frontiers of Materials, Photo-, and Theoretical Molecular Sciences

蛋白质折叠的分子机制，”2010年亚洲CORE计划年会“材料、光和理论分子科学前沿

• 发表时间: 2010
• 作者: T.Obayashi;S.Hayashi;M.Saeki;H.Ohta;K.Kinoshita;邦博桑島
• 通讯作者: 邦博桑島