A genotyping system capable of analyzing many teleost species

能够分析许多硬骨鱼物种的基因分型系统

• 批准号: 20380107
• 负责人: KIKUCHI Kiyoshi
• 金额: $ 10.32万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20380107/
• 关键词: 遺伝; 育種; トラフグ; メダカ; 棘鰭上目魚類; ゲノム; 比較ゲノム; 進化; 連鎖地図; 集団遺伝学; フグ

A large set of polymorphic markers are essential for applying molecular genetics to fish improvement. However, these markers are highly species-specific. To develop genetic markers that can be used in breeding program of many fish species, I first constructed a fugu genome map that covers 86% of genome assembly. I then compared it with the map of medaka, and revealed highly conserved features of fish genomes. By using the results of comparisons, I found a large number of marker loci that have been conserved among fish genomes. These markers successfully enabled me to construct a linkage map of chub mackerel without any information of its genome sequences, suggesting the versatility of the markers.

大量的多态性标记是应用分子遗传学进行鱼类改良所必需的。然而，这些标记具有高度的物种特异性。为了开发可用于许多鱼类育种的遗传标记，我首先构建了一个覆盖86%基因组组装的河豚基因组图谱。然后，我将其与青鳉的图谱进行了比较，并揭示了鱼类基因组的高度保守特征。利用比较结果，发现了大量在鱼类基因组中保守的标记位点。这些标记成功地使我能够构建一个连锁图谱的鲢鱼没有任何信息的基因组序列，表明标记的通用性。

项目成果

寄生虫の宿為特異性に関わるフグのゲノム領域

河豚基因组区域涉及寄生虫宿主特异性

• 发表时间: 2008
• 作者: 大賀浩史;入路光雄;北野載;S Selvaraj;金子賢介;清水昭男;山口明彦;松山倫也;畑直亜;木戸慎一ら
• 通讯作者: 木戸慎一ら

フグとメダカの比較から見える魚類ゲノムの進化

通过河豚和青鳉的比较观察鱼类基因组的进化

• 发表时间: 2008
• 作者: 梅澤俊明;鈴木史朗;長井敏;菊池潔
• 通讯作者: 菊池潔

皮膚に発現する二つのトラフグケモカイン

两种虎河豚趋化因子在皮肤中表达

• 发表时间: 2010
• 作者: Kubota;Y.;M. Osawa;L.M. Jakt;K. Yoshikawa;and S. Nishikawa;田内博久・末武弘章・菊池潔・鈴木譲・宮台俊明
• 通讯作者: 田内博久・末武弘章・菊池潔・鈴木譲・宮台俊明

魚類ゲノムワイド関連解析の可能性と問題点-トラフグの連鎖不平衡解析からの考察-

鱼类全基因组关联分析的可能性与问题——虎河豚连锁不平衡分析的思考——

• 发表时间: 2010
• 作者: 杉山清寛;太田有基;広瀬雄介;芳賀芳範;池田修悟;他;菊池潔・神谷隆史・甲斐渉・末武弘章・鈴木重則・鈴木譲
• 通讯作者: 菊池潔・神谷隆史・甲斐渉・末武弘章・鈴木重則・鈴木譲

Genetic approach foridentifying the genes responsible for resistance and susceptibility against a parasite, Heterobothrium okamotoi, in fugu, Takifugu rubripes

用于鉴定红鳍东方鲀中对寄生虫 Heterobothrium okamotoi 的抗性和易感性的基因的遗传方法

• 发表时间: 2009
• 作者: Kido,S.;Kai,W.;Suetake,H.;Kikuchi,K.;and Suzuki,Y.
• 通讯作者: and Suzuki,Y.