Systematic screening of viral host factors using a transposon-tagging method.

使用转座子标记方法系统筛选病毒宿主因子。

• 批准号: 20380111
• 负责人: YASUSHI Okinaka
• 金额: $ 11.81万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20380111/
• 关键词: ベータノダウイルス; 宿主因子; トランスポゾンタギング; 遺伝子破壊系; 魚類培養細胞; メダカ培養細胞; 遺伝子破壤系

We cloned a medaka (Oryzias latipes) HNI-2 cell line, the chromosome number of which was 25. We then introduced a transposon into the cells for gene disruption and obtained 17 betanodavirus-resistant and GFP-expressed cell lines (GFP expression indicates transposon insertion). DNA fragments adjacent to the inserted transposon were isolated from the genomic DNA prepared from each of the virus-resistant cells and used for blastn searches against the Ensembl medaka genome database. Nine sequences identified from the 17 resistant cell lines hit database sequences and five of which were revealed to encode proteins.

我们克隆了青鳉HNI-2细胞系，其染色体数目为25。然后，我们将转座子引入细胞中进行基因破坏，并获得了17个抗β-odavirus和GFP表达的细胞系（GFP表达表明转座子插入）。从由每个病毒抗性细胞制备的基因组DNA中分离与插入的转座子相邻的DNA片段，并用于针对Ensembl青鳉基因组数据库的blaerobic搜索。从17个耐药细胞系中鉴定出的9个序列与数据库序列相符，其中5个序列被发现编码蛋白质。

项目成果

メダカ培養細胞におけるRNA干渉を利用した遺伝子ノックダウン法の最適化

在培养的青鳉细胞中利用RNA干扰优化基因敲除方法

• 发表时间: 2010
• 作者: 善家孝介;冲中泰
• 通讯作者: 冲中泰

Genotype-specific binding of betanodaviruses to sevenband grouper cultured cells, SGF.

Betanodaviruses 与七带石斑鱼培养细胞 SGF 的基因型特异性结合。

• 发表时间: 2008
• 作者: Kawato;Y.
• 通讯作者: Y.

Identification of RNA regions that determine temperature sensitivity in betanodaviruses.

确定 Betanodaviruses 温度敏感性的 RNA 区域的鉴定。

• 发表时间: 2010
• 期刊: Arch.Virol. 155
• 作者: Hata N.;Okinaka;Y.;Iwamoto;T.;Kawato;Y.;Mori;K.;Nakai;T.
• 通讯作者: T.

ベータノダウイルスの宿主特異性決定機構の解明III 細胞膜上レセプター以外の決定機構の有無

Betanodavirus宿主特异性决定机制的阐明III.除了细胞膜受体之外还有其他决定机制吗？

• 发表时间: 2009
• 作者: Katsutoshi Ito;et al.;河東康彦・冲中泰・中井敏博・山下浩史
• 通讯作者: 河東康彦・冲中泰・中井敏博・山下浩史

メダカ培養細胞におけるRNA干渉誘導法の最適化

培养青鳉细胞中RNA干扰诱导方法的优化

• 发表时间: 2010
• 作者: 善家孝介;冲中泰
• 通讯作者: 冲中泰