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Database Development and Functional Analysis of Protein Disorder Regions

Database Development and Functional Analysis of Protein Disorder Regions
蛋白质无序区域的数据库开发和功能分析
批准号：
20500269
负责人：
SHIMIZU Kentaro
金额：
$2.91万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2008
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2008 至 2010
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20500269/
关键词：
プロテオーム生体生命情報学タンパク質不規則領域蛋白質構造予測構造評価構造精密化ブロテオーム

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We developed a new method for defining the degree of disorder of protein structures. The results of this analysis were stored in our protein disorder database. We also analyzed the relation between the disorder regions and functional sites of proteins.
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会议论文
A generalized conformational energy function of DNA derived from molecular dynamics simulations.
DOI： 10.1093/nar/gkp718
发表时间： 2009-11
期刊： Nucleic acids research
影响因子： 14.9
作者： [Yamasaki S, Terada T, Shimizu K, Kono H, Sarai A]
通讯作者： Sarai A
分子動力学シミュレーションによるWWドメインのフォールディング機構の解析
利用分子动力学模拟分析WW域的折叠机制
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [Yukiko Himeno, Chae Young Cha, Takao Shimayoshi, Akinori Noma, Nobuya Inagaki, Akira Amano, 広瀬修, 清水謙多郎, 西村麻彦,西謙一郎,寺田透,清水謙多郎]
通讯作者： 西村麻彦,西謙一郎,寺田透,清水謙多郎
計算的手法を用いた酵素設計:部位特異的変異によるパラ水酸化安息香酸水酸化酵素の基質特異性の改変
使用计算方法进行酶设计：通过定点诱变改变对羟基苯甲酸羟化酶的底物特异性
DOI： --
发表时间： 2009
期刊：
影响因子： --
作者： [Mizuki Morita, Shugo Nakamura, Kentaro Shimizu, W.Dawson, K.Sumikoshi, 中村周吾, 城野亮太, 池澤弘貴, 飛田晃介]
通讯作者： 飛田晃介
all-βタンパク質の二次構造拘束付きマルチカノニカル分子動力学シミュレーション
全β蛋白二级结构约束的多规范分子动力学模拟
DOI： --
发表时间： 2009
期刊：
影响因子： --
作者： [Mizuki Morita, Shugo Nakamura, Kentaro Shimizu, W.Dawson, K.Sumikoshi, 中村周吾, 城野亮太, 池澤弘貴, 飛田晃介, 山崎智, 西謙一郎, 西村麻彦]
通讯作者： 西村麻彦
共 43 条
    Development of protein-carbohydrate binding prediction systems and databases
    • 批准号：
      23300109
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $12.15万
    • 财政年份：
      2011
    • 负责人：
      SHIMIZU Kentaro
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    Gut flora and synbiotics therapy in patients with severe SIRS
    • 批准号：
      17591887
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.3万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      SHIMIZU Kentaro
    • 依托单位：
      Osaka University
    Development of methods for high-resolution protein structure modeling and for model structure assessment
    • 批准号：
      17500191
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.34万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      SHIMIZU Kentaro
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    Development of a Parallel Programming Environment based on Distributed Shared Arrays with Application-Specific Resource Management
    • 批准号：
      13680396
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.62万
    • 财政年份：
      2001
    • 负责人：
      SHIMIZU Kentaro
    • 依托单位：
      The University of Tokyo