Characterization of new identified novel human AP endonuclease
新鉴定的新型人类 AP 核酸内切酶的表征
基本信息
- 批准号:20510047
- 负责人:
- 金额:$ 3万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2008
- 资助国家:日本
- 起止时间:2008 至 2010
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
DUF2228 is a functionally unknown, conserved protein family distributed from worm to vertebrate including human. In insect and a part of worm DUF2228 protein has an additional domain containing a CYR motif (C2H2 zinc finger motif)in the N-terminal region. Since CYR motif was first identified in the human repair protein, PALF (ALPF), and found in various proteins of DNA metabolism, such as DNA repair and the DNA damage checkpoint, at their N-or C-termini, we hypothesized that DUF2228 family proteins have also DNA metabolism related functions. We isolated cDNA of Drosophila CG1218-PA and human C4orf27(APNX)belonging to DUF2228 and characterized these proteins. Here we show that ; 1)a Drosophila CG1218-PA protein accumulates at DNA damaged site in a poly-ADP-ribose-dependent manner. 2)Human APNX protein that lacks a CYR motif forms a hetero dimmer with PARP1 and accumulates at DNA damaged site in a PARP1-dependent manner. 3)CG1218-PA and APNX possess endo-and exonuclease activities against abasic site. 4)Suppression of the expression of APNX using siRNA in HeLa cells provided the cells with sensitivity to methyl methane sulfonate, which produces methylated bases leading to single-strand breaks. These data suggest that DUF2228 protein CG1218-PA and APNX play important roles in the repair of DNA base damage and single-strand breaks.
DUF 2228是一个功能未知的保守蛋白家族,从蠕虫到脊椎动物包括人类都有分布。在昆虫和部分蠕虫中,DUF 2228蛋白在N-末端区域具有含有CYR基序(C2 H2锌指基序)的额外结构域。由于CYR基序首先在人类修复蛋白PALF(ALPF)中被发现,并在各种DNA代谢蛋白中发现,如DNA修复和DNA损伤检查点,在其N-或C-末端,我们假设DUF 2228家族蛋白也具有DNA代谢相关功能。我们分离了果蝇CG 1218-PA和人C4 orf 27(APNX)属于DUF 2228的cDNA,并对这些蛋白进行了表征。我们发现:1)果蝇CG 1218-PA蛋白以聚ADP-核糖依赖的方式聚集在DNA损伤位点。2)缺乏CYR基序的人APNX蛋白与PARP 1形成异源二聚体,并以PARP 1依赖性方式在DNA损伤位点积累。(3)CG 1218-PA和APNX对脱碱基位点具有内切酶和外切酶活性。4)在HeLa细胞中使用siRNA抑制APNX的表达为细胞提供了对甲磺酸甲酯的敏感性,甲磺酸甲酯产生甲基化碱基,导致单链断裂。这些数据表明DUF 2228蛋白CG 1218-PA和APNX在DNA碱基损伤和单链断裂的修复中起重要作用。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A polycomb group protein, PHF1, is involved in the response to DNA double-trandf breaks in human cell
多梳蛋白 PHF1 参与人类细胞中 DNA 双链断裂的反应
- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hong;et.al.
- 通讯作者:et.al.
DUF2228 family-Characterization of a novel human endo/exonuclease
DUF2228 家族 - 新型人类内切/外切核酸酶的表征
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:菅野新一郎;渡邊礼子;安井明
- 通讯作者:安井明
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- DOI:10.1111/j.1365-2443.2009.01369.x
- 发表时间:2010-02-01
- 期刊:
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- 发表时间:2010-12-22
- 期刊:
- 影响因子:16
- 作者:Lan, Li;Ui, Ayako;Yasui, Akira
- 通讯作者:Yasui, Akira
DUF2228 family-ヒトを含む真核生物の新規AP-endo/exonuclease-の解析
DUF2228 家族-包括人类在内的真核生物中新型 AP-内切/外切核酸酶的分析
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:吉開大祐;依田浩敏;島本美保子;菅野新一郎
- 通讯作者:菅野新一郎
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