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Structural basis for the cleavage of VWF by ADAMTS-13 under shear forces

Structural basis for the cleavage of VWF by ADAMTS-13 under shear forces
ADAMTS-13 在剪切力下裂解 VWF 的结构基础
批准号：
20790030
负责人：
NISHIDA Noritaka
金额：
$2.75万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2008
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2008 至 2009
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20790030/
关键词：
構造生物学NMR血小板凝集VWFADAMTS-13

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Von Willebrand factor (VWF) mediates platelet adhesion under high shear stress. The activity of VWF is controlled by the ADAMTS13, which cuts the VWF in the force dependent manner. However, the structural basis as to how VWF exposes the cryptic site in the A2 domain for ADAMTS13 is unknown. In this study, I made a recombinant VWF A2 domain, using Pichia Pastorsis. Backbone resonance assignment of A2 domain was established for >80% signals. Based on the chemical shift change induced by low concentration of urea, the a3 and a5 helices and a4less loop, which is proximal to the scissile bond, undergoes a conformational change that would exposes the cleavage site for ADAMTS13.
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会议论文
Structure of an integrin with an αl domain, complement receptor type 4
具有 α1 结构域的整联蛋白的结构，补体受体 4 型
DOI： --
发表时间： 2010
期刊： The EMBO Journal 29
影响因子： --
作者： [Xie C, Zhu J, Chen X, Mi LZ, Nishida N, Springer TA, Can Xie]
通讯作者： Can Xie
Observation of NMR Signals from Proteins Introduced into Living Mammalian Cells by Reversible Membrane Permeabilization Using a Pore-Forming Toxin, Streptolysin O
DOI： 10.1021/ja904407w
发表时间： 2009-08-12
期刊： JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY
影响因子： 15
作者： [Ogino, Shinji, Kubo, Satoshi, Shimada, Ichio]
通讯作者： Shimada, Ichio
Shimada I "Two-state conformations in the hyarulonan-binding domain regulate CD44 adhesiveness under flow condition"
Shimada I“透明质酸结合域中的两种状态构象在流动条件下调节 CD44 粘附性”
DOI： --
发表时间： 2010
期刊： Structure 18
影响因子： --
作者： [Ogino S, Nishida N, Umemoto R, Suzuki M, Takeda M, Terasawa H, Kitayama J, Matsumoto M, Hayasaka H, Miyasaka M, Shimada I]
通讯作者： Shimada I
Springer TA "Structure of an integrin with anαI domain, complement receptor type 4"
Springer TA“具有 αI 结构域的整合素结构，补体受体 4 型”
DOI： --
发表时间： 2010
期刊： EMBO J 29
影响因子： --
作者： [Xie C, Zhu J, Chen X, Mi LZ, Nishida N, Springer TA]
通讯作者： Springer TA
共 11 条
    Affinity regulation mechanism of microtubule-binding domain of cytoplasmic dynein
    • 批准号：
      24770090
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额：
      $3.0万
    • 财政年份：
      2012
    • 负责人：
      NISHIDA Noritaka
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    国内基金
    海外基金
    适用膜蛋白-配体复合物结构测定的1H和19F距离约束检测的固体NMR方法研究
    • 批准号：
      JCZRYB202500181
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2025
    • 负责人：
    • 依托单位：
      武汉科技大学
    NMR-CRISPR体系的构建及在肝癌ctDNA及miRNA联合检测中的应 用
    基于 NMR 指纹特征图谱与代谢组学结合模式追踪土家药 血筒果实中抗类风湿关节炎的效应物质
    • 批准号：
      2024JJ6347
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2024
    • 负责人：
      苏维
    • 依托单位：
      湖南中医药大学
    基于ResNet-CNN和2D1H.13C HSQC NMR技术的多基原藏药'阿布卡'品质整合评控体系构建
    • 批准号：
      --
    • 项目类别：
      青年科学基金项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2024
    • 负责人：
      杜欢
    • 依托单位：
      成都市第三人民医院