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Identification of de novo DNA methylation signal by comparative genomics

Identification of de novo DNA methylation signal by comparative genomics
通过比较基因组学鉴定从头 DNA 甲基化信号
批准号：
20870008
负责人：
OKAMURA Kohji
金额：
$2.11万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
财政年份：
2008
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2008 至 2009
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20870008/
关键词：
ゲノムインプリンティングDNAメチル化CpGアイランド齧歯目重歯目脊椎動物新口動物エピジェネティクス進化遺伝子遺伝学核酸ゲノムインプリンティングメチル化アレル

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ネズミ目およびウサギ目特異的インプリンティングを受ける遺伝子Impactに着目し、卵形成で新規メチル化を受けるDNA配列を、ビーバー、リスなど約30種の動物で決定し、メチル化シグナル同定を目指してインプリンティングを受けない哺乳類ゲノムと比較解析を行った。その結果、これまで重要と考えられてきたリピート配列や、CpGおよびG+C含量ではなく、CpGサイト間の間隔がアレル別メチル化の確立に関わっていることが示唆された。
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会议论文
Gradual transition from mosaic to global DNA methylation patterns during deuterostome evolution Kohji Okamura
后口动物进化过程中从镶嵌模式逐渐转变为整体 DNA 甲基化模式 Kohji Okamura
DOI： --
发表时间： 2010
期刊： BMC Bioinformatics (in press)
影响因子： --
作者： [Kazuaki A. Matsumoto, Kenta Nakai]
通讯作者： Kenta Nakai
Characterization and definition of promoter-associated CpG islands in a scidian genomes
scidian 基因组中启动子相关 CpG 岛的表征和定义
DOI： --
发表时间： 2009
期刊：
影响因子： --
作者： [Okamura K, Yamashita R, Takimoto N, Nishitsuji K, Suzuki Y, Kusakabe TG, Nakai K]
通讯作者： Nakai K
無脊椎動物ホヤの大規模転写開始点決定から探るCpGアイランドプロモータの進化
通过大规模测定无脊椎动物海鞘中的转录起始位点探索 CpG 岛启动子的进化
DOI： --
发表时间： 2009
期刊：
影响因子： --
作者： [岡村浩司, 他6名]
通讯作者： 他6名
哺乳類に見られるグローバルなメチル化パターンの起源
哺乳动物中发现的全球甲基化模式的起源
DOI： --
发表时间： 2009
期刊：
影响因子： --
作者： [松本和晃, 岡村浩司, 中井謙太]
通讯作者： 中井謙太
共 14 条
    Compilation of somatic mutations using the clonality of iPS cells
    Evolutionary utilization of DNA methylation for regulation of gene expression in primitive vertebrates
    海外基金