Multifaceted exploration of nonhomogeneous and ambiguous data by combining partial similarities

通过结合部分相似性对非同质和模糊数据进行多方面探索

• 批准号: 20700134
• 负责人: TAKIGAWA Ichigaku
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20700134/
• 关键词: データマイニング; 部分構造探索; アルゴリズム; 機械学習; 部分構造検索; 列挙アルゴリズム; 統計的有意性検定; 統計的機械学習

Due to the computerization of industrial and scientific data, we can automatically collect or systematically obtain a huge dataset. Whereas these data are more easily accessible than before, their poor quality causes problems when we try to statistically analyze and utilize them. Many levels of information are collapsed into a single dataset since the purpose of use is ambiguous and unfixed in advance, and as a result, their quality is not sufficiently homogeneous. To address this problem, we developed novel statistical methods based on recently-emerged techniques for substructure enumeration, which can analyze those types of data by combining partial or local similarities in the data.

由于工业和科学数据的计算机化，我们可以自动收集或系统地获得庞大的数据集。虽然这些数据比以前更容易获得，但当我们试图对它们进行统计分析和利用时，它们的质量差会造成问题。许多层次的信息被压缩到一个单一的数据集，因为使用的目的是模糊的，事先不确定，因此，它们的质量不够均匀。为了解决这个问题，我们开发了新的统计方法的基础上，最近出现的子结构枚举技术，它可以分析这些类型的数据，结合部分或局部相似的数据。

项目成果

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Efficiently mining delta-tolerance closed frequent subgraphs

有效挖掘三角洲公差封闭频繁子图

• 发表时间: 2011
• 期刊: Machine Learning Vol.82, No.
• 作者: I.Takigawa;H.Mamitsuka
• 通讯作者: H.Mamitsuka

Efficiently finding significant substructural patterns conserved in glycans

有效地发现聚糖中保守的重要亚结构模式

• 发表时间: 2008
• 作者: I.Takigawa;K.Hashimoto;M.Shiga;M.Kanehisa;H.Mamitsuka
• 通讯作者: H.Mamitsuka

Efficiently finding genome-wide three-way gene interactions from transcript- and genotype-data

• DOI: 10.1093/bioinformatics/btp531
• 发表时间: 2009-11-01
• 期刊: BIOINFORMATICS
• 影响因子: 5.8
• 作者: Kayano, Mitsunori;Takigawa, Ichigaku;Mamitsuka, Hiroshi
• 通讯作者: Mamitsuka, Hiroshi

Mining metabolic pathways through gene expression

• DOI: 10.1093/bioinformatics/btq344
• 发表时间: 2010-09-01
• 期刊: BIOINFORMATICS
• 影响因子: 5.8
• 作者: Hancock, Timothy;Takigawa, Ichigaku;Mamitsuka, Hiroshi
• 通讯作者: Mamitsuka, Hiroshi