Predicting enzyme functions based on complementarily in molecular interactions by using radial distribution functions with a self-organizing maps

通过使用具有自组织图的径向分布函数，基于分子相互作用的互补性来预测酶功能

• 批准号: 20700263
• 负责人: UENO Keisuke
• 金额: $ 1.5万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20700263/
• 关键词: 酵素機能予測; 動径分布関数; 自己組織化写像; 分子間相互作用

We developed a method to predict enzyme functions by using radial distribution functions of active sites with a self-organizing map. The method outperformed the structural and sequence alignments with their low similarities.

我们开发了一种通过使用活性位点的径向分布函数和自组织图来预测酶功能的方法。该方法优于结构和序列比对，因为它们的相似性较低。

项目成果

Physicochemical Property of Enzyme-Ligand Interface for Molecular Interaction

分子相互作用的酶-配体界面的理化性质

• 发表时间: 2008
• 作者: Takahashi K;et al.;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;逸見昌之;Masayuki Henmi;逸見昌之;Masayuki Henmi;逸見昌之;逸見昌之;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;上野惠介;上野恵介;上野惠介
• 通讯作者: 上野惠介

Enzyme function classified with a catalytic-site similarity

根据催化位点相似性对酶功能进行分类

• 发表时间: 2009
• 作者: Takahashi K;et al.;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;逸見昌之;Masayuki Henmi;逸見昌之;Masayuki Henmi;逸見昌之;逸見昌之;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;上野惠介
• 通讯作者: 上野惠介

Landscaping Enzymatic Reactions of Oxidoreductases by a Self-Organizing Neural Network

通过自组织神经网络美化氧化还原酶的酶促反应

• 发表时间: 2008
• 作者: Takahashi K;et al.;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;逸見昌之;Masayuki Henmi;逸見昌之;Masayuki Henmi;逸見昌之;逸見昌之;Masayuki Henmi;Masayuki Henmi;上野惠介;上野恵介;上野惠介;上野恵介;上野惠介
• 通讯作者: 上野惠介