Development of DNA-interstrand cross-linking compounds and application to DNA scaffold

DNA链间交联化合物的开发及其在DNA支架中的应用

基本信息

批准号：
21510239
负责人：
KOMATSU Yasuo
金额：
$ 2.91万
依托单位：
National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2009
资助国家：
日本
起止时间：
2009 至 2011
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21510239/
关键词：
架橋 DNA RNA アミノオキシ安定化酵素疎水的相互作用連結

项目摘要

We have found that a single molecule containing bis(aminooxy) groups is capable of linking two AP sites, which are produced on "complementary" positions of double-stranded oligonucleotides. The aromatic molecule having two aminooxy groups showed much higher conjugation efficiency than the cross-linker with a straight alkyl chain. The interstrand cross-link(ICL) along with the stacking effect of the aromatic residue could stabilize the ICL duplex. We conducted two kinds of enzymatic reactions on the ICL-DNAs and showed that they have the potential to become stable nanosized scaffolds.

我们发现，一个包含双Bis（aminooxy）组的单个分子能够连接两个AP位点，这些位点是在双链寡核苷酸的“互补”位置上产生的。具有两个aminooxy基团的芳族分子显示出比与直烷基链的交联效率更高。链间交联（ICL）以及芳族残基的堆叠效果可以稳定ICL双链体。我们在ICL-DNA上进行了两种酶促反应，并表明它们有可能成为稳定的纳米骨架。

项目成果

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专利数量（0）

Hydroxylamine, Oxime and Hydroxamic Acid Derivatives of Nucleic Acids

核酸的羟胺、肟和异羟肟酸衍生物

DOI：
10.1002/9780470682531.pat0514
发表时间：
2010
期刊：
Hydroxylamines, Oximes and Hydroxamic Acids
影响因子：
0
作者：
Kojima;N. and Komatsu;Y
通讯作者：
Y

End-tether Structure of DNA Alters Electron-transfer Pathway of Redox-labeled Oligo-DNA Duplex at Electrode Surface

DNA 的末端系链结构改变电极表面氧化还原标记的寡聚 DNA 双链体的电子转移途径

DOI：
10.1246/cl.2012.62
发表时间：
2012
期刊：
Chemistry Letters
影响因子：
1.6
作者：
Mie;Y.;Kojima;N.;Kowata;K. and Komatsu;Y
通讯作者：
Y

遺伝子解析に活用する試薬の開発

开发用于遗传分析的试剂

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
Takeda;K.;Kato;K.;et al.;小松康雄
通讯作者：
小松康雄

遺伝子解析にかかわる試薬の開発

遗传分析相关试剂的开发

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
Synthesiology
影响因子：
0
作者：
小松康雄;小島直
通讯作者：
小島直

Construction of highly reactive probes for AP site detection by introduction of an aromatic and a guanidine residues into an aminooxy group.

通过将芳香族和胍残基引入氨基氧基，构建用于 AP 位点检测的高反应性探针。

DOI：
发表时间：
2009
期刊：
J.Am.Chem.Soc. 131
影响因子：
0
作者：
Kojima;N.;Takebayashi;T.;Mikami;A.;Ohtsuka;E. and Komatsu;Y;永坂正夫;狩山俊悟・小畠裕子・榎本敬;Naoshi Kojima
通讯作者：
Naoshi Kojima