Multidimensional energy analysis of pyridoxal-enzyme and quinoenzyme reactions

吡哆醛-酶和醌酶反应的多维能量分析

基本信息

  • 批准号:
    21570120
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 3.08万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2009
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2009 至 2011
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Multidimensional free energy analysis of the reactions of the catalytic reactions of two pyridoxal enzymes(serine palmitoyltransferase and threonine synthase) and a quinoenzyme cupper amine oxidase were carried out to elucidate the energetic mechanism of these enzymes. The mechanisms by which the versatile catalyst pyridoxal phosphate is organized to catalyze only one type of reaction, i. e., a stereochemical mechanism and the product-assisted catalysis, were clarified. Analysis of the reaction of cupper amine oxidase, together with the ultra-high-resolution structure of the enzyme, revealed that the dynamic motion of the enzyme provides the basis for the quantum tunneling effect that promotes its catalysis.
对吡哆醛酶(丝氨酸棕榈酰转移酶和苏氨酸合成酶)和醌酶铜胺氧化酶催化反应的反应进行了多维自由能分析,以阐明这些酶的能量机制。多功能催化剂磷酸吡哆醛的组织机制,以催化只有一种类型的反应,即。例如,立体化学机理和产物辅助催化作用。对铜胺氧化酶反应的分析,以及酶的超高分辨率结构,揭示了酶的动态运动为促进其催化作用的量子隧道效应提供了基础。

项目成果

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专利数量(0)
Product-assisted Catalysis as the Basis of the Reaction Specificity of Threonine Synthase
  • DOI:
    10.1074/jbc.m110.186205
  • 发表时间:
    2011-01-28
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Murakawa, Takeshi;Machida, Yasuhiro;Hayashi, Hideyuki
  • 通讯作者:
    Hayashi, Hideyuki
Multifunctional Role of His159in the Catalytic Reaction of Serine Palmitoyltransferase*
His159 在丝氨酸棕榈酰转移酶催化反应中的多功能作用*
生成物支援触媒によってもたらされる酵素の反応特異性
产物辅助催化带来的酶反应特异性
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    村川武志;林秀行
  • 通讯作者:
    林秀行
Product-assisted catalysis is the basis of the reaction specificity of threonine synthase
产物辅助催化是苏氨酸合酶反应特异性的基础
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    村川武志;岡島俊英;濱口章央;谷澤克行;林秀行;古宮栄利子;佐藤拓輝;Hideyuki Hayashi
  • 通讯作者:
    Hideyuki Hayashi
銅含有アミン酸化酵素の触媒機構:酸化的半反応中間体の立体構造解析
含铜胺氧化酶的催化机制:氧化半反应中间体的结构分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    喜久川政吾;岡島俊英;濱口章央;村川武志;林秀行;谷澤克行
  • 通讯作者:
    谷澤克行
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  • 财政年份:
    1976
  • 资助金额:
    $ 3.08万
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    X00090----957032
  • 财政年份:
    1974
  • 资助金额:
    $ 3.08万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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