Genomic analysis of the S-locus region and identification of the S determinant in wild barley, Hordeum bulbosum

野生大麦球茎大麦 S 基因座区域的基因组分析和 S 决定子的鉴定

• 批准号: 21580006
• 负责人: KAKEDA Katsuyuki
• 金额: $ 3.16万
• 依托单位: Mie University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21580006/
• 关键词: 自家不和合性; イネ科; S遺伝子; ゲノム解析; 自家不和合成

Hordeum bulbosum, a wild species of barley, possesses self-incompatibility(SI) controlled by unlinked two loci, S and Z. To search for a new candidate gene encoding the pollen S determinant, we conducted sequence analysis of the genomic region around the HPS10 gene, a promising candidate of the pistil S gene. DNA sequences of genomic clone contigs obtained from S1 and S3 haplotypes(50kb and 67kb, respectively) were completely determined and then subjected for prediction of genes and expression analysis. The results showed the presence of polymorphic genomic regions around HPS10 gene between two S haplotypes, where several genes expressed in reproductive tissues were detected. Furthermore, proteome analysis of the pollen proteins combined with the above-mentioned sequence data newly identified putative pollen proteins that may function as a recognition molecule of the SI.

摘要大麦Hordeum bulbosum具有自交不亲和性（self-incompatibility， SI），由未连锁的S和z两个基因座控制。为了寻找编码花粉S决定因子的新候选基因，我们对雌蕊S基因候选基因HPS10基因周围的基因组区域进行了序列分析。从S1和S3单倍型（分别为50kb和67kb）中获得基因组克隆contigs的DNA序列，然后进行基因预测和表达分析。结果表明，在两个S单倍型之间存在HPS10基因周围的多态性基因组区域，其中检测到生殖组织中表达的几个基因。此外，结合上述序列数据，对花粉蛋白进行蛋白质组学分析，发现了可能作为SI识别分子的花粉蛋白。

项目成果

Molecular and genomic analysis of the S locus region in wild barley, Hordeum bulbosum

野生大麦球茎大麦 S 基因座区域的分子和基因组分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 山内卓樹;塩野克宏;安彦友美;Rajhi Imene;高牟礼逸朗;堤伸浩;中園幹生;加藤清明;K. Kakeda
• 通讯作者: K. Kakeda

オオムギ属野生種におけるCly1ホモログの解析

大麦属野生物种中 Cly1 同源物的分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 嬉杏奈;古川薫;得字圭彦;高牟礼逸朗;加藤清明.;掛田克行
• 通讯作者: 掛田克行

オオムギ皮裸性遺伝子(Nud)を導入した形質転換イネの組織化学的解析

导入大麦裸露基因（Nud）的转基因水稻的组织化学分析

• 发表时间: 2009
• 作者: Ariyaratne M.;I.Takamure;K.Kato;石原倫光
• 通讯作者: 石原倫光

S locus-linked F-box genes expressed in anthers of Hordeum bulbosum

• DOI: 10.1007/s00299-009-0745-8
• 发表时间: 2009-07
• 期刊: Plant Cell Reports
• 影响因子: 6.2
• 作者: K. Kakeda

Comparative analysis of the S locus region in wild barley, Hordeum bulbosum

野生大麦球茎大麦S基因座区域的比较分析

• 发表时间: 2009
• 作者: Yasumoto;K;K. Kakeda
• 通讯作者: K. Kakeda