Functional analysis of GGDEF/EAL proteins that control the stability of small RNA

控制小RNA稳定性的GGDEF/EAL蛋白的功能分析

• 批准号: 21580088
• 负责人: SUZUKI Kazushi
• 金额: $ 3.24万
• 依托单位: Niigata University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21580088/
• 关键词: 大腸菌; バイオフィルム; GGDEFドメイン; EALドメイン; c-di-GMP; Csrシステム; small RNA; c-fi-GMP

To elucidate the mechanism of bacterial biofilm formation control, we analyzed the function of the GGDEF/EAL proteins in bacteria. GGDEF/EAL protein CsrD was not involved in c-di-GMP metabolism and altered the activity in each growth phase and controlled biofilm formation by regulating the stability of small RNA. On the other hand, YliF(GGDEF protein) and YliE(EAL protein) controlled biofilm formation by regulating the synthesis and degradation of c-di-GMP.

为了阐明细菌生物膜形成控制的机制，我们分析了细菌中GGDEF/EAL蛋白的功能。GGDEF/EAL蛋白CsrD不参与c-di-GMP代谢，但在各生长期改变其活性，并通过调节小RNA的稳定性来控制生物膜的形成。另一方面，YliF（GGDEF蛋白）和YliE（EAL蛋白）通过调节c-di-GMP的合成和降解来控制生物膜的形成。

项目成果

大腸菌におけるGGDEF-EALドメインタンパク質CsrDによるsmall RNA半減期の調節

GGDEF-EAL 结构域蛋白 CsrD 对大肠杆菌中小 RNA 半衰期的调节

• 发表时间: 2012
• 作者: 高橋優介,岡山明裕,伊藤学,杉本華幸,渡邉剛志,鈴木一史

大腸菌におけるGGDEF/EALドメインタンパク質の機能解析

大肠杆菌 GGDEF/EAL 结构域蛋白的功能分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 高橋優介,岡山明裕,伊藤学,杉本華幸,渡邉剛志,鈴木一史;塚田海斗,渡部大樹,杉本華幸,渡邉剛志,鈴木一史
• 通讯作者: 塚田海斗,渡部大樹,杉本華幸,渡邉剛志,鈴木一史

Analysis of CsrB small RNA decay in Escherichia coli

大肠杆菌中 CsrB 小 RNA 衰变分析

• 发表时间: 2009
• 作者: 鈴木一史,伊藤学,岡山明裕,水野孝彦,渡邉剛志;Tony Romeo;松田卓也,板谷光泰,片岡正和;鈴木一史
• 通讯作者: 鈴木一史

Analysis of turnover of the global regulatory RNA CsrB in Escherichia coli

大肠杆菌全局调节RNA CsrB的周转分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 鈴木一史,岡山明裕,伊藤学,渡邉剛志;Tony Romeo
• 通讯作者: Tony Romeo

大腸菌CsrB RNAの分解機構

大肠杆菌CsrB RNA的降解机制

• 发表时间: 2010
• 作者: 鈴木一史,岡山明裕,伊藤学,渡邉剛志;Tony Romeo;片岡正和;鈴木一史
• 通讯作者: 鈴木一史