Large-scale differential display system with vertebrate-common degenerate oligonucleotide primers

具有脊椎动物常见简并寡核苷酸引物的大规模差异显示系统

• 批准号: 21310044
• 负责人: TERAOKA Hiroki
• 金额: $ 9.73万
• 依托单位: Rakuno Gakuen University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21310044/
• 关键词: オミックス; エコトキシコロジー; カワウ; ゼブラフィッシュ; ダイオキシン; ニワトリ

To study possible impacts of environmental pollutants on gene expression in a variety of organisms, we developed a large-scale differential display system with primer sets that are common in 7 vertebrate species with detailed molecular background, based on degenerate oligonucleotide-primed PCR(DOP-PCR). Inverse repeat motif of 8 mer was found in most transcripts for 7 vertebrates examined from fish to primates and more than ten thousand motifs were commonly recognized in transcripts of these 7 species. Among these, we chose 275 common motifs that cover roughly 30% of transcripts throughout these species, making seven vertebrates-common DOP-PCR primers(common DOP primers). This system enabled us to find some genes responsive to 2, 3, 7, 8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin(TCDD) in fetal livers of chicken and common cormorant.

为了研究环境污染物对多种生物基因表达的可能影响，我们开发了一个大规模的差异显示系统，在7种脊椎动物中常见的引物，详细的分子背景，基于简并荧光素引物PCR（DOP-PCR）。从鱼类到灵长类的7种脊椎动物的转录本中，大多数都含有8聚体的反向重复基序，这7种脊椎动物的转录本中共有1万多个反向重复基序。其中，我们选择了275个共同的图案，涵盖了大约30%的转录本，在这些物种，使7个脊椎动物常见的DOP-PCR引物（共同DOP引物）。该系统使我们能够在鸡和普通鸬鹚的胎肝中发现一些对2，3，7，8-四氯二苯并-对-二恶英（TCDD）反应的基因。

项目成果

Role of cytochrome P450 1C genes in the reduced mesencephalic…

细胞色素 P450 1C 基因在中脑减少中的作用......

• 发表时间: 2009
• 作者: Kubota-A.;et al.
• 通讯作者: et al.

Molecular Cloning and Expression of Cytochrome P450 2D6 in the Liver of Domestic Cats

家猫肝脏细胞色素P450 2D6的分子克隆及表达

• 发表时间: 2010
• 期刊: Journal of Veterinary Medical Science
• 影响因子: 1.2
• 作者: Komatsu;T.;et al.
• 通讯作者: et al.

A helminthological survey in the waterfowls including Ardeidae,…

对包括鹭科在内的水禽进行蠕虫学调查……

• 发表时间: 2009
• 期刊: J.Yamashina.Inst.Ornithol. 41
• 作者: Yoshino-T.;et al.
• 通讯作者: et al.

Quantification of pericardial edema using high-speed camera : Involvement of prostanoid signaling in pericardial edema in early larvae…

使用高速相机量化心包水肿：前列腺素信号传导参与早期幼虫心包水肿......

• 发表时间: 2012
• 作者: Hiroki Teraoka;Ayumi Yamakoshi;Yuki Okuno;他1名
• 通讯作者: 他1名

ダイオキシンによる発達中ゼブラフィッシュの鰓弓動脈循環障害と心臓周囲浮腫との関係

二恶英所致斑马鱼鳃弓动脉循环障碍与心包水肿的关系

• 发表时间: 2011
• 作者: 山越あゆ美;奥野悠樹;平賀武夫;北澤多喜雄;寺岡宏樹
• 通讯作者: 寺岡宏樹