Chromatin immunoprecipitation-based analysis of transcriptional regulation in Arabidopsis thaliana chloroplasts

基于染色质免疫沉淀的拟南芥叶绿体转录调控分析

• 批准号: 21770034
• 负责人: HANAOKA Mitsumasa
• 金额: $ 2.33万
• 依托单位: Chiba University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21770034/
• 关键词: 葉緑体; 転写制御; ChIP; 環境応答; シロイヌナズナ; 色素体分化; シグマ因子; 転写因子

In this study, to further clarify transcriptional regulation in Arabidopsis thaliana chloroplasts, Chromatin immunoprecipitation (ChIP)-based method has been established. Novel target promoters for SIG1, an essential sigma factor in A.thaliana, as well as those for SIG5, a multiple stress-induced chloroplast sigma factor were identified respectively. These results suggest that ChIP analysis is useful to understand transcriptional regulation of chloroplast genes.

为了进一步阐明拟南芥叶绿体中的转录调控机制，本研究建立了基于染色质免疫沉淀（ChIP）的方法。分别鉴定了拟南芥中必需的sigma因子SIG1和多重胁迫诱导的叶绿体sigma因子SIG5的新靶启动子。这些结果表明，ChIP分析是有用的，以了解叶绿体基因的转录调控。

项目成果

ChIP法を用いたシロイヌナズナ葉緑体シグマ因子の機能解析

采用 ChIP 方法对拟南芥叶绿体 sigma 因子进行功能分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 華岡光正;加藤麻衣子;東美由紀;田中寛
• 通讯作者: 田中寛

単細胞紅藻 Cyanidioschzon merolae におけるオルガネラDNA複製の調節機構

单细胞红藻 Cyanidioschzon merolae 中细胞器 DNA 复制的调节

• 发表时间: 2010
• 作者: 華岡光正;加藤麻衣子;東美由紀;田中寛;Kie Itoh;華岡光正;金岡雅浩;岩崎義純
• 通讯作者: 岩崎義純

光合成機能を守るコア制御ネットワーク

保护光合功能的核心控制网络

• 发表时间: 2010
• 作者: Uehara;T.;Y.Iwasa.;弘中満太郎;田中寛
• 通讯作者: 田中寛

クロマチン免疫沈降法を利用したシロイヌナズナ葉緑体転写制御系の解析

使用染色质免疫沉淀分析拟南芥叶绿体转录控制系统

• 发表时间: 2010
• 作者: 華岡光正;加藤麻衣子;東美由紀;田中寛
• 通讯作者: 田中寛

アミロプラスト分化に際した遺伝子発現制御

淀粉体分化过程中基因表达的调控

• 发表时间: 2009
• 作者: 華岡光正;本橋典子;小沢友希;田中寛
• 通讯作者: 田中寛