Development of an efficient chromatin pull-down method from small cell numbers

开发一种有效的小细胞染色质下拉方法

• 批准号: 21770251
• 负责人: KURIMOTO Kazuki
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Kyoto University (2010-2011)The Institute of Physical and Chemical Research (2009)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21770251/
• 关键词: 生殖細胞; エピジェネティクス; ChIP; 次世代シークエンサー; 転写因子; Blimp1; Oct3/4; 始原生殖細胞; 転写制御因子; 免疫沈降; Oct3; 4

The aim of this research project is to develop a method to determine the binding sites of specific transcription factors that play important roles in specific cell lineages, such as primordial germ cells. To purify genomic DNA bound to a specific transcription factor, I developed knock-in mice that carry tags in the particular transcription factor. Furthermore, I developed a method to quantitatively amplify genomic DNA bound to a transcription factor. By these methods, it has become plausible to determine genomic sites bound to a transcription factor in a small cell number, such as 10, 000 cells.

该研究项目的目的是开发一种方法来确定在特定细胞谱系（如原始生殖细胞）中发挥重要作用的特定转录因子的结合位点。为了纯化与特定转录因子结合的基因组DNA，我开发了携带特定转录因子标签的敲入小鼠。此外，我开发了一种方法来定量扩增与转录因子结合的基因组DNA。通过这些方法，在小的细胞数量，如10，000个细胞中确定与转录因子结合的基因组位点变得似乎是合理的。

项目成果

哺乳類の生殖細胞形成を制御する分子機構実験医学Vol.27No.3(2月号)

控制哺乳动物生殖细胞形成的分子机制实验医学第27卷第3期（2月号）

• 发表时间: 2009
• 作者: 栗本一基;山路剛史;関由行;斎藤通紀
• 通讯作者: 斎藤通紀

Global transcription profiling of complex biological processes of cellular differentiation at the single-cell resolution

单细胞分辨率下细胞分化的复杂生物过程的全局转录谱分析

• 发表时间: 2010
• 作者: Saitou;M.;Kurimoto;K.
• 通讯作者: K.

TDRD5 is required for retrotransposon silencing, chromatoid body assembly, and spermiogenesis in mice.

• DOI: 10.1083/jcb.201009043
• 发表时间: 2011-03-07
• 期刊: The Journal of cell biology
• 作者: Yabuta Y;Ohta H;Abe T;Kurimoto K;Chuma S;Saitou M
• 通讯作者: Saitou M

卵子学/第I章卵子の発生と新生/3生殖系列の決定機構とその特性(栗本一基/斎藤通紀)

卵学/第一章卵子的发育和新生/3种系的决定机制及其特征（Kazuki Kurimoto/Michiki Saito）

• 发表时间: 2011
• 作者: 栗本一基;斎藤通紀;栗本一基/斎藤通紀
• 通讯作者: 栗本一基/斎藤通紀

新遺伝子工学ハンドブック(改訂第5版)

新基因工程手册（修订第5版）

• 发表时间: 2010
• 作者: 栗本一基;斎藤通紀
• 通讯作者: 斎藤通紀