Structural and functional analysis of high efficient DNA ligation complex

高效DNA连接复合物的结构和功能分析

• 批准号: 21780102
• 负责人: YAMADA Mitsugu
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Japan Atomic Energy Agency
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21780102/
• 关键词: 生体分子; タンパク質; 生物物理; 酵素反応; バイオテクノロジー; 構造生物

Two DNA ligase (DR2069, DRB0100) are identified in a genome of Deinococcus radiodurans.As a result of analysis, DR2069 was able to confirm DNA ligase activity, but DRB0100 was not able to confirm the DNA ligase activity.On the other hand, we carried out a crystallographic analysis of the DdrA protein which protected DNA from digestive enzymes before ligation with the DNA ligase and succeeded in crystallization and a diffraction data collection.Diffraction data were collected to 2.10 Å resolution and structural analysis are carrying out now.

两种DNA连接酶（DR2069，DRB 0100）。作为分析的结果，DR2069能够确认DNA连接酶活性，但是DRB 0100不能确认DNA连接酶活性。另一方面，我们对DdrA蛋白进行了晶体学分析，该蛋白在与DNA连接酶连接之前保护DNA免受消化酶的影响，并成功地结晶和衍射数据收集。衍射数据收集到2.10 nm分辨率，目前正在进行结构分析。

项目成果

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Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of DNA damage response A protein from Deinococcus radiodurans

耐辐射奇球菌 DNA 损伤反应 A 蛋白的纯化、结晶和初步 X 射线衍射研究

• 发表时间: 2010
• 期刊: R1Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 66
• 作者: Yamada M.;Satoh K.;Narumi I.
• 通讯作者: Narumi I.

放射線抵抗性細菌由来DNA修復促進タンパク質PprAの構造機能解析

PprA（一种源自抗辐射细菌的 DNA 修复促进蛋白）的结构和功能分析

• 发表时间: 2009
• 作者: 山田;貢
• 通讯作者: 貢

Structural and functional analysis of PprA from Deinococcus radiodurans

耐辐射奇球菌 PprA 的结构和功能分析

• 发表时间: 2009
• 作者: 山田貢;安達基泰;佐藤勝也;玉田太郎;由良敬;黒木良太;鳴海一成
• 通讯作者: 鳴海一成