Analysis of mRNP complex using gene knockin in mammalian cells

使用哺乳动物细胞中的基因敲入分析 mRNP 复合物

• 批准号: 21790289
• 负责人: YAMASHITA Akio
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Yokohama City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21790289/
• 关键词: 細胞医化学; 遺伝情報複製; 転写装置; 再編; 制御

I cloned genomic regions of VEGF, IL6, IL5, IFNbeta and IFNgamma. I constructed IFNbeta gene knockin vector for the insertion of BoxB sequence at downstream of termination codon. Next, I generate cell lines (HeLa TetOff, HeLaTetOnAdvanced, HCT116、BEAS-2B TetOff) which containing a single FRT recombination site. I also constructed the pTRE-Tight-FRT IL-6, IFNbeta, IL28B, and IL-5 full length genes.

我克隆了VEGF， IL6, IL5， IFNbeta和IFNgamma的基因组区域。构建IFNbeta基因敲入载体，在终止密码子下游插入BoxB序列。接下来，我生成含有单个FRT重组位点的细胞系（HeLa TetOff, HeLaTetOnAdvanced, HCT116, BEAS-2B TetOff）。我还构建了ptret - tight - frt的IL-6、IFNbeta、IL28B和IL-5全长基因。

项目成果

NMDと疾患

NMD 与疾病

• 发表时间: 2010
• 期刊: 細胞工学 29
• 作者: 臼杵扶佐子;山下暁朗
• 通讯作者: 山下暁朗

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Nonsense-Mediated mRNA Decay SMG-1 kinase is regulated by large-scale conformational changes controlled by SMG-8.

无义介导的 mRNA 衰变 SMG-1 激酶受到 SMG-8 控制的大规模构象变化的调节。

• 发表时间: 2011
• 期刊: Genes and Development.Genes Dev. 25(2)
• 作者: Arias-Palomo E;Yamashita A (co-first author);Fernandez IS;Nunez-Ramirez R;Bamba Y;Izumi N;Ohno S;Llorca S
• 通讯作者: Llorca S

AAA+ family ATPases, RUVBL1 and RUVBL2, coordinate PIKK family and play critical roles in Nonsense-mediated mRNA decay.

AAA 家族 ATP 酶 RUVBL1 和 RUVBL2 协调 PIKK 家族，并在 Nonsense 介导的 mRNA 降解中发挥关键作用。

• 发表时间: 2010
• 期刊: Science signaling (Science姉妹誌). (3)
• 作者: Izumi N;Yamashita A (corresponding author);Iwamatsu A;Kurata R;Nakamura H;Saari B;Hirano H;Anderson P;Ohno S
• 通讯作者: Ohno S

SMG-8 and SMG-9, two novel subunits of the SMG-1 complex, regulate remodeling of the mRNA surveillance complex during nonsense-mediated mRNA decay

• DOI: 10.1101/gad.1767209
• 发表时间: 2009-05-01
• 期刊: GENES & DEVELOPMENT
• 影响因子: 10.5
• 作者: Yamashita, Akio;Izumi, Natsuko;Ohno, Shigeo
• 通讯作者: Ohno, Shigeo