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新規ヒストン変異体ライブラリーを用いたヒストン化学修飾ネットワークの網羅的解析

使用新型组蛋白变体库全面分析组蛋白化学修饰网络

基本信息

批准号：
10J10716
负责人：
野口修平
金额：
$ 0.45万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10J10716/
关键词：
ヒストンヒストン化学修飾クロマチン

项目摘要

出芽酵母では、1種類のコアヒストンのテイルを欠損させた場合、致死にはならないことが既に知られている。テイル欠損株においては、当然のことながら欠損した部位には化学修飾は絶対に起こらない。故に化学修飾が一対一で対応しているというヒストンコード仮説を否定するに有力な証拠でもある。各テイルの化学修飾が生存に必須でないことは、ヌクレオソームの構造変換が生命の維持に重要であることに矛盾する。そこで、ヒストンの化学修飾は、「いくつかのノードが無くなったとしても、別の経路によりネットワーク構造が保たれる特徴を持つスケールフリーネットワークである」と提唱したヒストン"modification web"の考え方が合理的である。つまり、無くなった化学修飾残基の機能が、他の化学修飾残基によって補われている可能性が考えられる。実際、H2AとH2Bのテイルを同時に欠損させると致死になる。H3とH4も同様に致死になることが知られている。これは、H2AとH2Bが、H3とH4がお互いに機能を補い合っていることが予想される。さらに、[H2A or H2B]と[H3 or H4]の関連性についても、いくつかの残基で知られており、[H2A or H2B]と[H3 or H4]間でも機能が補えあえる可能性があるといえる。このようにしてヒストンテイルの化学修飾ネットワークの網羅的解析により、ヒストン"modification web"がスケールフリーのネットワークとして成立しているのかを実験的に検証する。そのためには[H2A or H2B]と[H3 or H4]にまたがるテイル欠損株の作製が必要であり、出芽酵母ではヒストン遺伝子が2個ずつあり、作製が困難で、これまで誰も作ったことが無い。本研究では、目的のテイル欠損株の完成まで、残り1ステップの段階まで到達することができた。

Sprouting yeast, 1 type of yeast, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1 No, no. So in chemistry, I don't know. I don't know. I don't know. In order to maintain the vital importance of life, it is necessary to maintain the importance of life and conflicts in the survival of chemical engineering. The chemical repairs, the chemical repairs, the chemical repairs, The possibility of chemical repair of chemical residues and other chemical repair residues is tested. At the same time, there is no need to reduce the risk of death in the same period of time. H3