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In-silico prediction of active comformations by machine learning

通过机器学习对活性构象进行计算机预测

基本信息

批准号：
21680025
负责人：
TSUDA Koji
金额：
$ 12.73万
依托单位：
National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
财政年份：
2009
资助国家：
日本
起止时间：
2009 至 2012
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21680025/
关键词：
機械学習生体分子生理活性

项目摘要

The amount of protein 3D structure information is ever increasing as the number of registered proteins in Protein Data Bank (PDB) exceeded 70,000. To extract functional information, we developed a fast all pairs similarity search a

随着蛋白质数据库(PDB)中注册蛋白质的数量超过7万个，蛋白质三维结构信息量不断增加。为了提取功能信息，我们提出了一种快速的所有对相似度搜索算法

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Multi-way set enumeration in weight tensors

DOI：
10.1007/s10994-010-5210-y
发表时间：
2011-02-01
期刊：
MACHINE LEARNING
影响因子：
7.5
作者：
Georgii, Elisabeth;Tsuda, Koji;Schoelkopf, Bernhard
通讯作者：
Schoelkopf, Bernhard

Mining significant substructure pairs for interpreting polypharmacology in drug-target network.

DOI：
10.1371/journal.pone.0016999
发表时间：
2011-02-23
期刊：
PloS one
影响因子：
3.7
作者：
Takigawa I;Tsuda K;Mamitsuka H
通讯作者：
Mamitsuka H

Submodularity Cuts and Applications

DOI：
发表时间：
2009-12
期刊：
影响因子：
0
作者：
Y. Kawahara;Kiyohito Nagano;K. Tsuda;J. Bilmes
通讯作者：
Y. Kawahara;Kiyohito Nagano;K. Tsuda;J. Bilmes

Junichi Ito

伊藤润一

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kentaro Tomii
通讯作者：
Kentaro Tomii

SlideSort: all pairs similarity search for short reads.

SlideSort：所有对相似性搜索短读。

DOI：
10.1093/bioinformatics/btq677
发表时间：
2011-02-15
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
0
作者：
Shimizu K;Tsuda K
通讯作者：
Tsuda K

DOI：
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作者：
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TSUDA Koji其他文献

アフリカ農村における食料分配のしくみと機能：ケニア灌漑事業区の農民によるコメの消費過程の分析

非洲农村粮食分配机制与作用：肯尼亚灌溉项目区农民稻米消费过程分析

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
農林水産政策研究
影响因子：
0
作者：
Makito Haruta;Yuki Kurauchi;Ayaka Kimura;Yasumi Ohta;Toshihiko Noda;Kiyotaka Sasagawa;Takashi Tokuda;Hiroshi Katsuki;Jun Ohta;TSUDA Koji;新田龍希;Maya Suzuki;鈴木　真弥;伊藤紀子
通讯作者：
伊藤紀子

Kung Yung Pao, The Only Daily Newspaper for the Ethnic Chinese in Java during Japanese Occupation: An Overview

日本占领时期爪哇华人唯一的日报《公永报》：概述

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Makito Haruta;Anek Wuthayavanich;Kazutaka Osawa;Toshihiko Noda;Kiyotaka Sasagawa;Takashi Tokuda;and Jun Ohta;TSUDA Koji
通讯作者：
TSUDA Koji

1920年代前半の中国における地方教育会の組織改革 ―湖南省教育会に着目して―

1920年代初中国地方教育协会的组织改革——以湖南省教育协会为中心——

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
アカデミア社会科学編
影响因子：
0
作者：
菅原由美（責任編集・著）;川島緑　他（著）;Kobayashi Ryosuke;上田裕之;佐藤仁史;中町信孝;倉本尚徳;津田浩司;小林亮介;Satoru Nakamura;上田裕之;Kawashima Midori and Kushimoto Hiroko;TSUDA Koji;倉本尚徳;宮原佳昭
通讯作者：
宮原佳昭

第一次世界大戦期のイギリス・中国・チベット関係 ―東チベット境界紛争（1917-1918）を中心に―

第一次世界大战期间的英中藏关系 - 聚焦西藏东部边界争端（1917-1918） -

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
菅原由美（責任編集・著）;川島緑　他（著）;Kobayashi Ryosuke;上田裕之;佐藤仁史;中町信孝;倉本尚徳;津田浩司;小林亮介;Satoru Nakamura;上田裕之;Kawashima Midori and Kushimoto Hiroko;TSUDA Koji;倉本尚徳;宮原佳昭;津田浩司;小林亮介
通讯作者：
小林亮介