Analysis of Transcriptional Regulation of Genome by Pathogenicity Transcription Factor LeuO.

致病性转录因子LeuO对基因组转录调控的分析。

• 批准号: 21710198
• 负责人: SHIMADA Tomohiro
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Hosei University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21710198/
• 关键词: ゲノム発現制御; 転写; 病原性細菌; 転写因子LeuO; Genomic SELEX; 薬剤耐性; サルファ剤耐性遺伝子; SELEX-chip; バイオフィルム; 転写因子Cra; 転写因子CRP; 大腸菌

To get insights into the regulatory role(s) of LeuO, attempts were made to identify the whole set of regulation targets using Genomic SELEX system. A total of 140 LeuO-binding sites were identified on the E.coli genome, 125 of which were newly identified. Taken together with our previous finding of the involvement of LeuO in mutli-drug efflux, it was revealed that LeuO regulates a number of genes for biofilm formation including the genes for fimbriae formation.

为了深入了解LeuO的调控作用，尝试使用Genomic SELEX系统鉴定整个调控靶标集。在大肠杆菌基因组上共鉴定了140个LeuO结合位点，其中125个是新鉴定的。与我们先前发现的LeuO参与多药物外排一起，揭示了LeuO调节许多生物膜形成的基因，包括菌毛形成的基因。

项目成果

Genomic SELEX for the genome-wide search of regulation targets by transcription factors : SELEX-clos and SELEX-chip procedures.

用于通过转录因子进行全基因组调控靶标搜索的基因组 SELEX：SELEX-clos 和 SELEX-chip 程序。

• 发表时间: 2009
• 期刊: Micro-Nano Mechatronics Human Sci. 2009
• 作者: Shimada;T.;Fujita;N.;Yamamoto;Y.;Ishihama;A.
• 通讯作者: A.

Genomic SELEXを用いた大腸菌転写因子LeuOの転写制御機構解析

利用Genomic SELEX分析大肠杆菌转录因子LeuO的转录控制机制

• 发表时间: 2009
• 作者: 島田友裕;山本兼由;石浜明
• 通讯作者: 石浜明

Novel technologies for the genome-wide search of regulation targets by transcription factors : genomic SELEX and SELEX-chip. Micro- and Nano-Mechatronics and Human Science

通过转录因子进行全基因组调控靶点搜索的新技术：基因组 SELEX 和 SELEX 芯片。

• 发表时间: 2009
• 作者: Shimada;T.;et al.
• 通讯作者: et al.

大腸菌炭素源代謝制御のふたつの転写因子CRPとCraによるゲノム転写制御の全体像:Genomic SELEX法を用いた解析

控制大肠杆菌碳源代谢的两种转录因子CRP和Cra的基因组转录调控全貌：使用Genomic SELEX方法进行分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 野地沙也加;不破春彦;佐々木誠;岡村美佳;林威光・藤井大雅・樫田啓・浅沼浩之;寺本潤;小田有沙;山口恭平・原雄一・樫田啓・浅沼浩之;島田友裕
• 通讯作者: 島田友裕

Involvement of the leucine response transcription factor LeuO in regulation of the genes for sulfa drug efflux.

亮氨酸反应转录因子 LeuO 参与磺胺药物流出基因的调节。

• 发表时间: 2009
• 作者: 島田友裕・山本兼由・石浜明